[发明专利]一种15 有效
申请号: | 201711332504.3 | 申请日: | 2017-12-13 |
公开(公告)号: | CN108265095B | 公开(公告)日: | 2020-11-24 |
发明(设计)人: | 胡俊杰;范洪波;李衍亮;吴康铭;劳志朗;林勃机;袁美怡;朱丹;梁志辉;曾燕艳 | 申请(专利权)人: | 东莞理工学院 |
主分类号: | C12P19/38 | 分类号: | C12P19/38;C07H19/10;C07H1/06;C12R1/19 |
代理公司: | 宁波高新区核心力专利代理事务所(普通合伙) 33273 | 代理人: | 涂萧恺 |
地址: | 523808 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 base sup 15 | ||
1.一种15N稳定性同位素标记5-甲基脱氧胞苷的制备方法,包括以下步骤:
步骤1、选用菌株;步骤1中的菌种选取基因组DNA中胞嘧啶含量丰富的大肠杆菌;
步骤2、制备含有15N氯化铵的葡萄糖培养基和液体活化培养基;所述步骤2中液体活化培养基的配方为:0.125%(m/v)蛋白胨,0.25%(m/v)酵母提取物,15-35 mM磷酸氢二钠,3-5mM葡萄糖溶于水,HAC调整pH6.0;所述步骤2中含有15N氯化铵的葡萄糖培养基:以葡萄糖为唯一碳源的M9基本培养基,其配方为:氯化钠30-80 mM,硫酸二氢钾15-35 mM,氯化钙50-90mM,硫酸镁1-4 mM,葡萄糖5-15 mM,15N氯化铵30-80 mM的混合水溶液,pH 6-8;
步骤3、将步骤1所选用的菌株在步骤2制备的两种培养基中培养;取1环活化好的步骤1大肠杆菌斜面种子接入步骤2所制得的液体活化培养基,37℃振荡培养12-15小时,摇床转速为160 rpm,作为预培养种子;将所述预培养种子接种到步骤2制得的含有15N氯化铵的葡萄糖培养基,接种量为5-8%,37 ℃振荡培养48小时,摇床转速为160 rpm;
步骤4、细菌基因组DNA的提取和保存;采用300 g离心力对步骤3所得培养物离心10分钟,收获培养的细菌;采用常规细菌基因组DNA提取试剂盒方法提取基因组DNA,所述试剂盒方法至少包含细菌裂解步骤、RNA酶降解RNA步骤以及柱层析富集DNA步骤;所述基因组DNA保存于含Tris–HCl 10 mM,氯化钠50 mM,二硫苏糖醇1 mM,氯化镁10 mM的pH 7.9混合水溶液体系中;
步骤5、CviPI DNA甲基化酶催化反应;每100 mg 基因组DNA中加入100-200 U CviPIDNA甲基化酶;反应缓冲液含有:s-腺苷甲硫氨酸32-64 mM,氯化钠50 mM,Tris-HCl 50 mM,二硫苏糖醇10 mM,pH 8.5,37 ℃下反应4-6小时;反应结束后加入冰乙醇,12000 g离心提取甲基化后的基因组DNA;
步骤6、基因组DNA水解,15N 5-甲基脱氧胞苷分离纯化;每100 mg 甲基化后的基因组DNA中加入200-400 U核酸酶P1,1-4 U磷酸二酯酶,300-700 U碱性硫酸酶;反应缓冲液含有:0.1 M乙酸铵,1 M碳酸氢铵,pH 5.3,37 ℃下反应2-6小时;水解后形成的脱氧胞苷混合物经过C18制备分离柱分离,收集洗脱液,经过冷冻干燥后得到15N 5-甲基脱氧胞苷晶体。
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