[发明专利]一种制备DNA编码化合物文库的方法及起始头片段化合物和制得的DNA编码化合物有效
| 申请号: | 201711318894.9 | 申请日: | 2017-12-12 |
| 公开(公告)号: | CN108070009B | 公开(公告)日: | 2021-04-13 |
| 发明(设计)人: | 吴阿亮;张在红;裴增飞;黄书宽;龚平秀;周园园;李科;陈雯婷;邢莉;杨洪芳;彭宣嘉 | 申请(专利权)人: | 上海药明康德新药开发有限公司 |
| 主分类号: | C07H1/00 | 分类号: | C07H1/00;C07H21/04;C12P19/34;C40B40/06;C40B50/06 |
| 代理公司: | 上海浦一知识产权代理有限公司 31211 | 代理人: | 郑权 |
| 地址: | 200131 上海市浦*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 制备 dna 编码 化合物 文库 方法 起始 片段 | ||
1.一种制备含有两个或多个药效团的DNA编码化合物文库的起始头片段化合物,其特征在于,所述起始头片段化合物包括一条核苷酸链,该核苷酸链的5’和3’分别具有可以进行化学反应的基团R1和R2,该核苷酸链上具有n个连接头,所述连接头是由该核苷酸链上的一个或多个核苷酸单体经修饰后延伸出的长链,每个长链上均具有一个或多个可进行化学反应的位点Gn,其中n = 2、3、……、20;不同长链上的位点G是相互之间不会发生直接化学反应的功能团。
2.如权利要求1所述的化合物,其特征在于,所述核苷酸链是由正常核苷酸单体聚合得到的,和/或是由人工修饰后的核苷酸单体聚合后得到的,包括肽核酸,所述核苷酸链为单链或双链。
3.如权利要求2所述的化合物,其特征在于,当所述核苷酸链是单链时,没有碱基修饰的核苷酸单链的部分碱基可以互补配对,形成一个大的发卡结构,发卡末端留有m个碱基作为配对区,m是2到20之间的整数。
4. 如权利要求3所述的化合物,其特征在于,所述发卡结构的互补区域的碱基序列中有p个酶切位点或q个可以通过化学反应进行切断的功能团,p、q = 0、1、2、3、4、5,p和q不同时为0。
5.如权利要求4所述的化合物,其特征在于,所述酶切位点所使用的限制性内切酶选自:AflIII、AscI、AvaI、BamHI、BglII、BssHII、BstEII、BstXI、ClaI、EcoRI、HaeIII、HindIII、KpnI、MluI、NcoI、NdeI、NheI、NotI、NsiI、PacI、PmeI、PstI、PvuI、SacI、SacII、SalI、ScaI、SmaI、SpeI、SphI、StuI、XbaI、XhoI和XmaI。
6.如权利要求4所述的化合物,其特征在于,可通过化学反应进行切断的功能团有:二硫键、羟胺键、重氮键、偶氮键、硅氧键、2-硝基苯基丙二醇类醚键、邻二醇键、砜乙基氧羰基键、三芳基膦亚甲基羰基键、巯乙基硫酸酯键。
7.如权利要求1所述的化合物,其特征在于,延伸出来的长链来自同一个修饰过的核苷酸单体,修饰的位置可以是碱基,可以是五碳糖,可以是磷酸基团,也可以是其他人工修饰过的核苷酸单体的任意位置。
8.如权利要求1所述的化合物,其特征在于,延伸出来的长链来自不同的修饰过的核苷酸单体,该核苷酸单体可以是A、T、C和G中任意一个,修饰的位置可以是碱基,可以是五碳糖,可以是磷酸基团,也可以是其他人工修饰过的核苷酸单体的任意位置。
9. 如权利要求1所述的化合物,其特征在于,带有长链的修饰过的核苷酸单体可以连续出现,可以单独出现,可以在一条核苷酸单链上,也可以同时出现在核苷酸双链的两条单链上,任意相邻的两个带有长链的修饰过的核苷酸单体间可以间隔o个碱基,o = 0、1、2、3、……、20。
10.如权利要求7所述的化合物,其特征在于,该延伸出来的长链可以是长烷基链,也可以是聚乙二醇链,或是它们的交叉形式,不同的长链的原子个数可以是相同的,也可以是不相同的。
11.如权利要求1所述的化合物,其特征在于,G1、G2和Gn选自氨基、仲胺基、叔丁氧羰基胺基、芴甲氧羰基胺基、6-硝基藜芦氧基胺基、烯丙氧基羰基胺基、邻硝基苯磺酰基胺基、甲砜基乙氧羰基胺基、三氟乙酰基胺基、硝基、羧基、甲氧羰基、乙氧羰基、叔丁氧羰基、杂环芳氯、芳基氟、芳基碘、芳基溴、醛基、二甲氧基缩醛、二乙氧基缩醛、乙二醇缩醛、酮基、二甲氧基缩酮、二乙氧基缩酮、乙二醇缩酮、叠氮、炔基、胺氧基、二环[6.1.0]壬炔、烷基溴、烷基氯、二苯并环辛炔、2,4-二硝基苯、马来酰亚胺、磷酸、磷酸乙酯、磺酸、羟基、巯基。
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