[发明专利]预测蛋白质间相互作用的方法、装置、介质及电子设备

说明书

本公开涉及一种预测蛋白质间相互作用的方法、装置、介质及电子设备。方法包括：获取待预测的目标蛋白质序列对，其包括第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列；确定第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列各自的同源蛋白质序列；将两个目标蛋白质序列的同源蛋白质序列两两进行组合，获得至少一个同源蛋白质序列对；根据至少一个同源蛋白质序列对，在已知蛋白质序列对中进行检索；若在已知蛋白质序列对中检索到预定数量的同源蛋白质序列对时，预测第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列之间具有相互作用。由此，可实现蛋白质间相互作用的快速、准确地预测，为生物研究人员进行生物实验提供较为可靠的数据支持。

技术领域

本公开涉及生物信息领域，具体地，涉及一种预测蛋白质间相互作用的方法、装置、介质及电子设备。

背景技术

随着生命科学研究的不断发展，人们逐渐意识到基因组信息已不能完全解释和预测各种生命过程及现象。蛋白质作为细胞活性和功能的执行者，越来越受到人们的关注。然而，蛋白质功能的发挥不是凭借单个蛋白质独立执行的，而是依靠蛋白质与蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction，PPI)来执行其生命功能的。因此，预先掌握蛋白质间相互作用将会有助于理解细胞内生化反应机理，进而指导医药品的开发、植物品种的改良等。

在过去十多年中，多种生物实验技术如酵母双杂交(Yeast Two-hybrid，Y2H)技术、串联亲和纯化(Tandem Affinity Purification，TAP)技术等已经应用于蛋白质相互作用的识别，并积累了大量的实验数据。然而生物实验操作繁琐，耗时耗力。

发明内容

为了解决相关技术中存在的问题，本公开提供一种预测蛋白质间相互作用的方法、装置、介质及电子设备。

为了实现上述目的，本公开提供一种预测蛋白质间相互作用的方法，所述方法包括：

获取待预测的目标蛋白质序列对，所述目标蛋白质序列对包括第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列；

确定所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列和所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列；

将所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列与所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列两两进行组合，获得至少一个同源蛋白质序列对；

根据所述至少一个同源蛋白质序列对，在已知蛋白质序列对中进行检索，其中，每个所述已知蛋白质序列对中的两个蛋白质序列被认证具有相互作用；

若在所述已知蛋白质序列对中检索到预定数量的所述同源蛋白质序列对时，预测所述第一目标蛋白质序列和所述第二目标蛋白质序列之间具有相互作用。

可选地，所述确定所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列和所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列，包括：

计算所述第一目标蛋白质序列与信息库中的每个蛋白质序列之间的相似度，并将与所述第一目标蛋白质序列的相似度大于第一预设阈值的蛋白质序列确定为所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列，其中，所述信息库中预先存储有多个蛋白质序列；

计算所述第二目标蛋白质序列与所述信息库中的每个蛋白质序列之间的相似度，并将与所述第二目标蛋白质序列的相似度大于第二预设阈值的蛋白质序列确定为所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列。

可选地，所述根据所述至少一个同源蛋白质序列对，在已知蛋白质序列对中进行检索，包括：

计算所述目标蛋白质序列对与每个所述同源蛋白质序列对之间的相似度；