[发明专利]预测蛋白质间相互作用的方法、装置、介质及电子设备

权利要求书

1.一种预测蛋白质间相互作用的方法，其特征在于，所述方法包括：

获取待预测的目标蛋白质序列对，所述目标蛋白质序列对包括第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列；

确定所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列和所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列；

将所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列与所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列两两进行组合，获得至少一个同源蛋白质序列对；

根据所述至少一个同源蛋白质序列对，在已知蛋白质序列对中进行检索，其中，每个所述已知蛋白质序列对中的两个蛋白质序列被认证具有相互作用；

若在所述已知蛋白质序列对中检索到预定数量的所述同源蛋白质序列对时，预测所述第一目标蛋白质序列和所述第二目标蛋白质序列之间具有相互作用。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述确定所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列和所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列，包括：

计算所述第一目标蛋白质序列与信息库中的每个蛋白质序列之间的相似度，并将与所述第一目标蛋白质序列的相似度大于第一预设阈值的蛋白质序列确定为所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列，其中，所述信息库中预先存储有多个蛋白质序列；

计算所述第二目标蛋白质序列与所述信息库中的每个蛋白质序列之间的相似度，并将与所述第二目标蛋白质序列的相似度大于第二预设阈值的蛋白质序列确定为所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于，所述根据所述至少一个同源蛋白质序列对，在已知蛋白质序列对中进行检索，包括：

计算所述目标蛋白质序列对与每个所述同源蛋白质序列对之间的相似度；

根据所述至少一个同源蛋白质序列对中、与所述目标蛋白质序列对之间的相似度大于第三预设阈值的同源蛋白质序列对，在已知蛋白质序列对中进行检索；或者，根据所述至少一个同源蛋白质序列对中、按照与所述目标蛋白质序列对之间的相似度从大到小的顺序排在前n位的同源蛋白质序列对，在已知蛋白质序列对中进行检索，其中，n≥1。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述计算所述目标蛋白质序列对与每个所述同源蛋白质序列对之间的相似度，包括：

通过以下方式计算所述目标蛋白质序列对与每个所述同源蛋白质序列对之间的相似度：

其中，JointE_i表示所述目标蛋白质序列对与第i个所述同源蛋白质序列对之间的相似度；E_Ai表示第i个所述同源蛋白质序列对中，所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列与所述第一目标蛋白质序列之间的相似度；E_Bi表示第i个所述同源蛋白质序列对中，所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列与所述第二目标蛋白质序列之间的相似度。

5.一种预测蛋白质间相互作用的装置，其特征在于，所述装置包括：

获取模块，用于获取待预测的目标蛋白质序列对，所述目标蛋白质序列对包括第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列；

确定模块，用于确定所述获取模块获取到的所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列和所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列；

组合模块，用于将所述确定模块确定出的所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列与所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列两两进行组合，获得至少一个同源蛋白质序列对；

检索模块，用于根据所述组合模块获得的所述至少一个同源蛋白质序列对，在已知蛋白质序列对中进行检索，其中，每个所述已知蛋白质序列对中的两个蛋白质序列被认证具有相互作用；

预测模块，用于若所述检索模块在所述已知蛋白质序列对中检索到预定数量的所述同源蛋白质序列对时，预测所述第一目标蛋白质序列和所述第二目标蛋白质序列之间具有相互作用。