[发明专利]一种与凡纳滨对虾生长性状相关的EST-STR标记Lv-F36a及其扩增引物和应用

说明书

本发明公开了一种与凡纳滨对虾生长性状相关的EST‑STR标记Lv‑F36a及其扩增引物和应用。本发明利用关联分析方法确定1个与凡纳滨对虾生长性状相关的EST‑STR标记，并进一步分析该EST‑STR位点的等位基因片段长度与生长性状的关联性，该EST‑STR位点扩增片段长度包含424bp、434bp、438bp和440bp的基因型仅在生长快速的凡纳滨对虾中检测到，且在生长快和生长慢的个体中差异显著，提示上述4个基因型为生长快速的优势基因型。本发明建立了凡纳滨对虾生长快速优良品种分子标记辅助选育的技术体系，为快速选育凡纳滨对虾优良品种奠定基础。

技术领域：

本发明涉及水产生物技术领域，具体涉及一种与凡纳滨对虾生长性状相关的EST-STR标记Lv-F36a及其扩增引物和应用。

背景技术：

凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)是全世界产量最大的养殖对虾。由于人工繁育群体容易引起遗传衰退，因此，必须通过良种选育才能保障凡纳滨对虾养殖业的可持续发展。近年来，以分子标记为基础的分子标记辅助选育技术在水产育种中得到了广泛应用，加快了良种选育的进程。

微卫星(microsatellite)，又称短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats,SSRs)，为共显性标记，具有多态性丰富、重复性好、遗传稳定和可检测杂合子等优点，弥补了扩增片段长度多态性(amplified fragmentlength polymorphism,AFLP)和随机扩增多态性(random amplified polymorphic DNA,RAPD)等技术的不足，是目前在水产养殖动物遗传育种领域应用较广泛的分子标记技术。然而，迄今为止，凡纳滨对虾EST-STR标记的开发较少，尚无与性状相关联的EST-STR标记的开发。因此，本发明针对凡纳滨对虾的生长性状开发凡纳滨对虾生长性状相关EST-STR标记，以期用于凡纳滨对虾生长快速优良品种的辅助选育，从而加快凡纳滨对虾优良品种的选育进程。

发明内容：

本发明的目的是提供一种与凡纳滨对虾生长性状相关的EST-STR标记Lv-F36a及其扩增引物和应用。以期用于凡纳滨对虾生长快速优良品种的辅助选育，从而加快凡纳滨对虾优良品种的选育进程。

为实现上述发明目的，本发明以生长快和生长慢的凡纳滨对虾DNA为模板，通过PCR扩增和测序来检测这些模板在8个高度多态性EST-STR位点的等位基因片段长度，并通过关联分析方法确定与凡纳滨对虾生长性状相关的EST-STR标记，同时提供EST-STR位点扩增引物，建立凡纳滨对虾生长快速优良品种分子标记辅助选育的技术体系，为快速选育凡纳滨对虾优良品种奠定基础。

本发明的第一个目的是提供一种与凡纳滨对虾生长性状相关的EST-STR标记Lv-F36a，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

本发明的第二个目的是提供一种与凡纳滨对虾生长性状相关的EST-STR标记Lv-F36a的扩增引物，包括以下引物：

F：5’-GCCTCGGTAACATTGTGAAGAG-3’；

R：5’-ACAGCAACCAGGGTATTCAGG-3’。

优选，所述的扩增引物的正向引物的5’端标记有荧光基团。

所述的荧光基团优选为TAMRA、HEX或FAM。

本发明的第三个目的是提供上述的EST-STR标记Lv-F36a或扩增引物在凡纳滨对虾分子标记辅助育种中的应用。