[发明专利]一种与凡纳滨对虾生长性状相关的EST-STR标记Lv-F36a及其扩增引物和应用有效
申请号: | 201711250042.0 | 申请日: | 2017-12-01 |
公开(公告)号: | CN108034729B | 公开(公告)日: | 2021-03-05 |
发明(设计)人: | 任春华;江晓;吴小芬;黄文;陈廷;胡超群 | 申请(专利权)人: | 中国科学院南海海洋研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星;胡素丽 |
地址: | 511458 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 凡纳滨 对虾 生长 性状 相关 est str 标记 lv f36a 及其 扩增 引物 应用 | ||
1.一种与凡纳滨对虾生长性状相关的EST-STR标记Lv-F36a的扩增引物,其特征在于,包括以下引物:
F:5’-GCCTCGGTAACATTGTGAAGAG-3’;
R:5’-ACAGCAACCAGGGTATTCAGG-3’。
2.根据权利要求1所述的扩增引物,其特征在于,所述的扩增引物的正向引物的5’端标记有荧光基团。
3.根据权利要求2所述的扩增引物,其特征在于,所述的荧光基团为TAMRA、HEX或FAM。
4.权利要求1所述的扩增引物在凡纳滨对虾分子标记辅助育种中的应用。
5.一种凡纳滨对虾生长快速优良品种的选育方法,其特征在于,包括以下步骤:提取待测凡纳滨对虾基因组DNA作为模板,用权利要求3所述的扩增引物进行PCR扩增,采用测序仪对PCR扩增产物进行分型,并利用软件读取等位基因片段的长度,选择扩增片段长度包含424bp、434bp、438bp或440bp的个体进行留种和建立家系,以选育凡纳滨对虾生长快速优良品种。
6.根据权利要求5所述的选育方法,其特征在于,所述的提取待测凡纳滨对虾基因组DNA具体为:取待测凡纳滨对虾的1个腹肢,以腹肢作为材料提取基因组DNA。
7.根据权利要求5所述的选育方法,其特征在于,所述的PCR扩增,其反应体系为25μL,包括:不含Mg2+的10×PCR buffer 2.5μL、25mM MgCl2 2.0μL,10mM dNTP 0.5μL、5U/μL高保真PCR酶0.2μL、10μM正向引物0.5μL、10μM反向引物0.5μL、DNA模板12.5ng,其余由无菌双蒸水补足至25μL。
8.根据权利要求5~7任一项所述的选育方法,其特征在于,所述的PCR扩增,其反应程序为:95℃预变性5分钟;95℃变性30秒,60℃退火30秒,72℃延伸30秒,共35个循环;72℃再延伸6分钟。
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