[发明专利]基于Cpf1的植物基因组定点编辑方法有效
申请号: | 201711249583.1 | 申请日: | 2017-12-01 |
公开(公告)号: | CN108130342B | 公开(公告)日: | 2022-01-11 |
发明(设计)人: | 朱健康;王木桂;毛妍斐;陆钰明 | 申请(专利权)人: | 中国科学院分子植物科学卓越创新中心 |
主分类号: | C12N15/82 | 分类号: | C12N15/82;C12N9/22;A01H5/00;A01H6/46;A01H6/20;A01H6/54;A01H6/82 |
代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 崔佳佳;马莉华 |
地址: | 200031 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 cpf1 植物 基因组 定点 编辑 方法 | ||
1.一种用于植物基因组定点编辑的核酸构建物,其特征在于,所述的核酸构建物包括第一表达盒和第二表达盒;
其中,所述的第一表达盒为Cpf1-NLS融合蛋白表达盒,其中所述的Cpf1-NLS融合蛋白具有式I结构:
P1-A-B1-C-B2-D-B3-E1 (I)
式中,
P1为第一启动子;
A为无、信号肽、和/或蛋白标签序列;
B1为无或核定位信号序列NLS;
B2为无或核定位信号序列NLS;
B3为无或核定位信号序列NLS;
附加条件是,B1、B2和B3中至多一个为无;或者B1和B3为无,而B2为核定位信号序列NLS;
C为Cpf1的N端片段元件;
D为Cpf1的C端片段元件;
E1为第一终止子;
其中,所述的N端片段元件和C端片段元件共同构成一个完整的Cpf1蛋白;
以及,所述的第二表达盒为crRNA表达盒,在所述的crRNA表达盒含有对应于成熟型crRNA的编码序列;
所述Cpf1选自下组:FnCpf1 、LbCpf1;
并且所述的第二表达盒具有式II结构crRNA表达盒:
P2-(R-S)q-T (II)
式中,
P2为第二启动子;
各R独立地为对应于成熟型直接重复序列(direct repeat, DR)
各S独立地为目标位点引导序列sg;
q为2-10;
T为无或终止序列。
2.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第一表达盒和第二表达盒分别位于不同的表达载体上。
3.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第一表达盒和第二表达盒位于同一表达载体上。
4.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述核定位信号序列NLS选自或来自下组:SV40、KRP2、MDM2、CDc25C、DPP9、MTA1、CBP80、AreA、M9、Rev、hTAP、MyRF、EBNA-6、TERT、Tfam、或其组合。
5.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的C对应于Cpf1蛋白的第1位至第n位的氨基酸序列,其中n为691-718或615-633的正整数。
6.如权利要求5所述的核酸构建物,其特征在于,n为692-717(FnCpf1)或616-632(LbCpf1)中任一正整数。
7.如权利要求5所述的核酸构建物,其特征在于,n为709(FnCpf1)或627(LbCpf1)。
8.如权利要求5所述的核酸构建物,其特征在于,所述的D对应于Cpf1蛋白的第n+1位至第m位的序列,其中n如上定义,m为全长Cpf1的最后一个氨基酸的位置编号。
9.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述B2位于Cpf1多肽的非保守区。
10.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述终止序列选自下组:polyT、NOS、polyA或其组合。
11.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第二表达盒为具有式III或IV结构crRNA表达盒:
P2-R-S-R-T (III)
P2-(R-S)q-R-T (IV)。
12.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,各S为sg序列。
13.如权利要求12所述的核酸构建物,其特征在于,所述的sg序列的长度为17-35nt。
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