[发明专利]一种MGMT基因启动子甲基化的检测方法及其引物组在审
申请号: | 201711216625.1 | 申请日: | 2017-11-28 |
公开(公告)号: | CN109837341A | 公开(公告)日: | 2019-06-04 |
发明(设计)人: | 裘敏燕 | 申请(专利权)人: | 上海联吉医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200331 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甲基化 检测 启动子 引物组 甲基化特异性PCR 启动子CpG岛 分子生物学 半导体芯片 分析和评估 样本基因组 测序技术 基因技术 理论基础 医学领域 灵敏度 新途径 扩增 通量 个性化 筛选 测试 敏感 分析 | ||
1.一种MGMT基因启动子甲基化的检测方法及其引物组,具体步骤为:
利用生物信息学知识和相关生物信息学软件,对公开数据库中所能检索到的MGMT基因启动子CpG岛序列信息,用Primer Premier 5.0软件设计PCR引物;
采用甲基化特异性PCR(MSP)方法对待检测样本基因组DNA进行C-T转化及PCR扩增;
将PCR扩增产物进行扩增子文库的构建,ISP(Ion Sphere™ Particles, Ion微球)模板的制备,在Ion Torrent PGM系统上进行测序,并用软件对相关测序序列进行分析。
2.如权利要求1所述一种MGMT基因启动子甲基化的检测方法及其引物组,其特征在于一组甲基化特异性PCR引物,其序列分别为:SEQ ID No: 1- SEQ ID No:2:
5’- agggagtggtgagtttcggatatgttgggatagt -3’ SEQ ID No: 1;
5’- acaacccaaacactcaccaaat -3’ SEQ ID No: 2。
3.如权利要求1所述一种MGMT基因启动子甲基化的检测方法及其引物组,其特征在于一组甲基化特异性PCR引物组成一种检测MGMT基因启动子甲基化的试剂盒。
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