[发明专利]一种检测核苷酸特异性和/或非特异性吸附的方法在审
申请号: | 201711175562.X | 申请日: | 2017-11-22 |
公开(公告)号: | CN108034699A | 公开(公告)日: | 2018-05-15 |
发明(设计)人: | 赵陆洋;黄天逊;吴增丁;颜钦 | 申请(专利权)人: | 深圳市瀚海基因生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6837 | 分类号: | C12Q1/6837;G06T7/00 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 彭家恩;彭愿洁 |
地址: | 518000 广东省深圳市罗湖区莲塘*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 核苷酸 特异性 非特 异性 吸附 方法 | ||
1.一种检测核苷酸特异性和/或非特异性吸附的方法,其特征在于,所述方法包括:
使待测核苷酸与第一模板链反应,所述第一模板链与第一芯片上的探针连接,所述第一芯片包括基底表面以及一端固定在该基底表面的探针,所述第一模板链带有第一标记,所述待测核苷酸能够与所述第一模板链的相应碱基配对,从而使所述探针的另一端延伸一个碱基,所述待测核苷酸带有第二标记,所述第一标记能够产生第一信号,所述第二标记能够产生第二信号;
检测所述第一芯片上的信号,获得第一检测结果;
使所述待测核苷酸与第二模板链反应,所述第二模板链与第二芯片上的探针连接,所述第二芯片包括基底表面以及一端固定在该基底表面的探针,所述第二模板链带有所述第一标记,所述待测核苷酸与所述第二模板链的相应碱基不能配对,无法使所述探针的另一端延伸一个碱基;
检测所述第二芯片上的信号,获得第二检测结果;
基于所述第一检测结果和所述第二检测结果,检测所述待测核苷酸的特异性和/或非特异性吸附。
2.一种检测核苷酸非特异性吸附的方法,其特征在于,所述方法包括:
使待测核苷酸与第三模板链反应,所述第三模板链与第三芯片上的探针连接,所述第三芯片包括基底表面以及一端固定在该基底表面的探针,所述第三模板链带有第三标记,所述待测核苷酸与所述第三模板链的相应碱基不能配对,无法使所述探针的另一端延伸一个碱基,所述待测核苷酸带有第四标记,所述第三标记能够产生第三信号,所述第四标记能够产生第四信号;
检测所述第三芯片上的信号,获得第三检测结果;
使所述待测核苷酸与第四模板链反应,所述第四模板链与第四芯片连接,所述第四芯片包括不带探针的基底表面,所述第四模板链带有所述第三标记,所述待测核苷酸能够与所述第四模板链的相应碱基配对;
检测所述第四芯片上的信号,获得第四检测结果;
基于所述第三检测结果和所述第四检测结果,检测所述待测核苷酸的非特异性吸附。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述第一芯片和第二芯片上的探针随机分布和/或规则分布在基底表面上;和/或
所述第三芯片上的探针随机分布和/或规则分布在基底表面上。
4.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,
(i)所述检测所述第一芯片上的信号,获得第一检测结果包括:通过成像系统对所述第一芯片表面进行拍照,获得第一图像;以及检测所述第一图像,以获得所述第一检测结果;
所述检测所述第二芯片上的信号,获得第二检测结果包括:通过所述成像系统对所述第二芯片表面进行拍照,获得第二图像;以及检测所述第二图像,以获得所述第二检测结果;和/或
(ii)所述检测所述第三芯片上的信号,获得第三检测结果包括:通过成像系统对所述第三芯片表面进行拍照,获得第三图像;以及检测所述第三图像,以获得所述第三检测结果;
所述检测所述第四芯片上的信号,获得第四检测结果包括:通过所述成像系统对所述第四芯片表面进行拍照,获得第四图像;以及检测所述第四图像,以获得所述第四检测结果。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,
(i)中检测所述第一图像,以获得所述第一检测结果包括:检测所述第一图像,以确定所述第一芯片表面上同时存在第一信号和第二信号的位置的数量Na1以及只存在第二信号的位置的数量Na3;
检测所述第二图像,以获得所述第二检测结果包括:检测所述第二图像,以确定所述第二芯片表面上同时存在第一信号和第二信号的位置的数量Nb1以及只存在第二信号的位置的数量Nb3;和/或
(ii)中检测所述第三图像,以获得所述第三检测结果包括:检测所述第三图像,以确定所述第三芯片表面上同时出现第三信号和第四信号的位置的数量Nc1以及只出现第四信号的位置的数量Nc3;
检测所述第四图像,以获得所述第四检测结果包括:检测所述第四图像,以确定所述第四芯片表面上同时出现第三信号和第四信号的位置的数量Nd1以及只出现第四信号的位置的数量Nd3。
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