[发明专利]一种快速鉴别南、北疆分布的新疆裸重唇鱼的分子生物学方法

说明书

本发明公开了一种快速鉴别南、北疆分布的新疆裸重唇鱼的分子生物学方法，其具体技术方案为：提取南、北疆分布的新疆裸重唇鱼基因组DNA；利用PCR反应扩增新疆裸重唇鱼基因组中Tc1类转座子；构建新疆裸重唇鱼DNA电泳模式图；鉴定南、北疆分布的新疆裸重唇鱼。上述PCR反应引物序列为：5′‑TAC AGT TGA AGT CGG AAG TTT ACA TAC‑3′。有益效果为：本发明采用Tc1类转座子单引物对新疆裸重唇鱼进行扩增鉴别的方法，从基因特征上区别南、北疆不同水系分布的地理种群，为该物种的鉴定提供可靠依据，也为增殖放流亲本来源和苗种质量起到技术保障。

技术领域

本发明属于分子生物技术领域，具体涉及一种快速鉴别南、北疆分布的新疆裸重唇鱼的分子生物学方法。

背景技术

新疆裸重唇鱼（Gymnodiptychus dybowskii），俗称裸黄瓜鱼，隶属鲤形目（Cypriniformes）、鲤科（Cyprinidae）、裂腹鱼亚科（Schizothoracinae）、裸重唇鱼属（Gymnodiptychus）。主要分布于我国伊犁河流域、天山北坡准噶尔盆地诸水域，南疆开都河，以及中亚地区锡尔河、巴尔喀什湖支流上游、伊塞克湖等。新疆裸重唇鱼作为伊犁河水系具有代表性的土著种和生态敏感种，近年来由于受到掠夺式捕捞、水利水电工程修建以及生态污染等因素的影响，野生种群资源遭到严重破坏，2004年已被新疆维吾尔自治区人民政府列为Ⅰ类水生野生保护动物。近年来，随着国家水生生物资源养护行动的实施，当地渔政部门陆续在伊犁河流域开展新疆裸重唇鱼的增殖放流活动，为了有效的防止不同水系间新疆裸重唇鱼种质混杂和性状衰退，在形态学鉴别的基础上，有必要采用分子生物学手段开展不同水系新疆裸重唇鱼野生种群的鉴别，以保证放流苗种亲本来源的可靠性。

转座子（Transposon）又称为跳跃基因、易位子，是在原核生物和真核生物基因组中广泛存在的，可自主复制和移动的一段DNA序列。是导致基因组遗传不稳定性的主要内在因素之一，也是构成生物体生长、发育和遗传的重要调节因子。Tc1-Mariner超家族是真核生物基因组中分布最广泛的DNA转座子（DNA Transposon）家族之一。Tc1-like转座子是该超家族中的一类，Tc1最初是作为引起线虫多态性的一个重复序列而被发现，也是线虫基因组中首次被鉴定的DNA转座子，与Tc1具有相似结构的转座子统称Tc1类转座子（Tc1-likeelements，TLEs），该转座子在硬骨鱼类基因组中占有较高的比例。

发明内容

本发明的目的在于提供一种快速鉴别南、北疆分布的新疆裸重唇鱼的分子生物学方法，该方法采用Tc1类转座子单引物对新疆裸重唇鱼进行扩增鉴别的方法，从基因特征上区别南、北疆不同水系分布的地理种群，为该物种的鉴定提供可靠依据，也为增殖放流亲本来源和苗种质量起到技术保障。

本发明针对上述技术中提到的问题，采取的技术方案为：

一种快速鉴别南、北疆分布的新疆裸重唇鱼的分子生物学方法，其具体技术方案为：

提取南、北疆分布的新疆裸重唇鱼基因组DNA；

利用PCR反应扩增新疆裸重唇鱼基因组中Tc1类转座子；

对扩增产物用进行电泳分离，染色，构建新疆裸重唇鱼DNA电泳模式图；

鉴定南、北疆分布的新疆裸重唇鱼。

作为优选，PCR反应引物序列为：5′-TAC AGT TGA AGT CGG AAG TTT ACA TAC-3′。