[发明专利]人类X染色体18个基因座复合扩增体系

说明书

本发明公开了人类X染色体18个基因座复合扩增体系。本发明公开的人类X染色体18个基因座复合扩增体系由基于X染色体上的DXSGATA31E08、DXS10079、DXS10103、DXS7132、DXS9895、DXS7133、DXS7424、DXS7423、DXS6789、DXS9902、DXS6810、DXS8377、DXS101、HPRTB、DXS8378、DXS6797、DXS6804和GATA165B12的基因座位点以及Amelogenin的19个引物对组成，这19个引物对的序列分别为序列表中序列1‑38。实验证明，本发明的体系可以用于检测个体间是否具有共同来源X染色体。

技术领域

本发明涉及生物技术领域中，人类X染色体18个基因座复合扩增体系。

背景技术

短串联重复序列(short tendem repreat,STR)属于第二代遗传标记，由于其重复单元小、突变速率高、在基因组中分布广等特点，现已广泛应用于群体遗传学及法医学领域。在人类基因组中，大约每15-20kb就有一个STR位点，它们占人类基因组总量的10％。这些STR通常由2-6个碱基组成串联重复单元，由于重复单元及重复次数的不同，它们在不同种族、地域的人群中显示出较大的差异性，表现为遗传多态性。

最早应用于法医遗传学领域的是人类常染色体STR，至今国内外已有比较成型的扩增、检测试剂盒及相关技术路线，扩增位点数目不断增加。同时，常染色体STR数据库的建成，为案件侦破及罪犯特征刻画提供了条件。目前已有至少39个X染色体STR基因座(记为X-STR基因座)应用于法医学实践。父亲的X染色体单倍型遗传给女儿，母亲的X染色体单倍型随机遗传给子女，根据X-STR基因座的遗传特点，X-STR基因座可以应用于父女鉴定、母子鉴定、同胞、半同胞、隔代亲缘关系、乱伦等特殊亲缘关系鉴定案件中，X-STR基因座的密度与常染色体相当，X-STR基因座的突变率也与常染色体STR相近，约为2.09×10^-3。X-STR基因座均位于同一染色体上，当两个X-STR基因座的物理或遗传距离很近时，必须考虑两个基因座连锁遗传的可能性。由于存在连锁和连锁不平衡，在实际应用中，必须考虑其带来的影响，有学者研究了8个X-STR的连锁和连锁不平衡现象，进一步证实了连锁遗传较常见，并且会影响似然比的计算。目前应用最广的基因座复合体系是凯杰的Argus X-12试剂盒，但由于我国还未确定X-STR核心基因座位点，因此不同复合体系间X-STR基因座位点差异较大，以凯杰的Argus X-12，中德美联的AGCU X19，阅微的Microreader 19X三个试剂盒为例，发现共同的基因座共有四个，分别为：HPRTB、DXS10079、DXS10135、DXS7423，故不同复合体系间的兼容性较差。X-STR的应用建立在人群等位基因分型和基因频率研究之上，目前可以在X-STR数据库(http://www.chrx-str.org/)进行人群遗传学参数的计算，但不同等位基因的基因频率需要根据不同地区和人种进行计算和统计，因此目前有大量的研究是针对X-STR不同复合体系的遗传多态性研究，在国内研究的种族人群覆盖了浙江汉族、广东汉族、河南汉族、桂林汉族、新疆维族等。

自HPRTB和ARA两个X-STR基因座用于法医学检验以来，越来越多的X-STR基因座被开发应用于亲权鉴定的特殊案件中。X-STR基因座在实际应用中已经发挥着越来越重要的作用，特别是在一些亲缘关系鉴定中，通过增加X-STR基因座的检验，其检验效能显著提高。有研究人员证实，在仅有母亲残骸的母子关系鉴定、缺乏父亲的同胞姐妹亲缘关系鉴定、同父异母姐妹亲缘关系鉴定中，X-STR基因座作为其他遗传标记的重要补充，显示在此类案件中X-STR基因座与常染色体STR具有同等价值。在一些重大的灾难事故现场，需要做亲缘关系鉴定，传统的方法是通过父母子的三联体进行鉴定，在只具备单亲进行亲缘关系鉴定的条件下，可以通过联合检验常染色体STR和X-STR进行亲缘关系鉴定。