[发明专利]一种用于检测燕麦属植物染色体的探针组、试剂盒及应用

说明书

本发明提供一种用于检测燕麦属植物染色体的探针组、试剂盒及应用。探针组包括Aml、(ACT)₆、(GAA)₆、(TTG)₆四种探针，其中Aml的碱基序列为：5′‑GATCCATGTGTGGTTTGTGGAAAGAAC ACACATGCAATGACT CTAGTGGTT‑3′；(ACT)₆的碱基序列为：5′‑ACTACTACTACTACTACT‑3′；(GAA)₆的碱基序列为：5′‑GAAGAAGAAGAAGAAGAA‑3′；(TTG)₆的碱基序列为：5′‑TTGTTGTTGTTGTTGTTG‑3′。该探针组为识别燕麦属植物染色体的18‑51bp寡序列探针，有助于建立稳定便捷的荧光原位杂交反应体系。

技术领域

本发明属于荧光原位杂交探针的应用领域，具体涉及一种用于检测燕麦属植物染色体的探针组、试剂盒及应用。

背景技术

现有检测燕麦属植物染色体的方法有C带，GISH，FISH，等。C带能使异染色质着色，这种异染色质通常位于着丝粒周围并常含有高度重复序列的DNA，此方法观察到的图片为黑白图片，信号位置局限在着丝粒周围。GISH，即基因组原位杂交技术，是以总基因组序列为探针标记染色体，探针准备要求大量高浓度基因组DNA，局限在于基因组染色体亲缘关系近时不能被区别，另外封阻比例将影响杂交信号强弱，片子回收利用难度大，实验重复性不强，图片为彩色。FISH，即荧光原位杂交技术，多以几百碱基DNA片段为探针，探针浓度要求较低，使用量少，可以识别GISH不能识别的近缘基因组染色体，无需封阻，片子回收再利用容易，便于对同一片子进行多次杂交实验，图片为多色。

本发明通过设计、合成用于检测燕麦属植物染色体的18-51bp的寡序列探针，建立稳定便捷的荧光原位杂交反应体系，克服了现有燕麦属植物染色体检测的诸多问题，为燕麦属植物染色体的检测提供新方法。

发明内容

针对现有技术存在的问题，本发明提供一种用于检测燕麦属植物染色体的探针组、试剂盒及应用。本发明的技术方案为：

第一个方面，本发明提供一种用于检测燕麦属植物染色体的探针组，包括Aml、(ACT)₆、(GAA)₆、(TTG)₆四种探针，其中所述Aml探针由51个碱基对组成，其碱基序列为：5′-GATCCATGTGTGGTTTGTGGAAAGAACACACATGCAATGACTCTAGTGGTT-3′，用于特异性识别燕麦属C基因组所有染色体；所述(ACT)₆探针的碱基序列为：5′-ACTACTACTACTACTACT-3′，用于识别偏好C基因组部分染色体的部分结构，也微弱识别A染色体组部分染色体的部分结构；所述(GAA)₆探针的碱基序列为：5′-GAAGAAGAAGAAGAAGAA-3′，用于识别偏好A和C基因组部分染色体的部分结构；所述(TTG)₆探针的碱基序列为：5′-TTGTTGTTGTTGTTGTTG-3′，用于识别偏好A基因组部分染色体部分结构，微弱识别C基因组部分染色体的部分结构。

进一步地，所述Aml探针采用FAM或者TAMRA标记其序列的5’端。

进一步地，所述(ACT)₆探针采用FAM或者TAMRA标记其序列的5’端。

进一步地，所述(GAA)₆探针采用FAM或者TAMRA标记其序列的5’端。

进一步地，所述(TTG)₆探针采用FAM或者TAMRA标记其序列的5’端。

第二个方面，本发明提供一种用于检测燕麦属植物染色体的试剂盒，包括：

(1)上述探针组；

(2)酶解液；