[发明专利]一种MMAF致病新基因及其应用

说明书

一种MMAF致病新基因及其应用，涉及精子尾部多种形态异常疾病的标记物及其应用。更具体而言，经过大规模全外显子组测序筛选，首次发现一种MMAF致病新基因CFAP43。以MMAF多个患病家系及患病个体为研究对象，对家系中的患病个体进行了外显子组测序和比较，发现不同患者CFAP43基因存在不同的基因突变。利用这些突变可以对精子尾部多种形态异常进行检测。

技术领域

本发明涉及基因，尤其是涉及一种MMAF致病新基因及其应用。

背景技术

精子尾部多种形态异常(mμltiple morphological abnormalities of thesperm flagella,MMAF)是一种隐性遗传的导致男性不育的畸形精子症，是一种很少见的遗传疾病，其主要临床特征是五种精子尾部异常的总和，包括短尾、无尾、卷尾、弯尾以及尾部宽度不规则。早期研究中也有文献称这个病为纤维鞘发育不良(dysplasia of thefibrous sheath，DFS)、短尾精子症(short tails，stump tails)。国外早期的分子方面发病机制研究发现DNAH1基因发生了突变(Ben Khelifa M,Coutton C,Zouari R,KaraouzeneT,Rendu J,Bidart M,Yassine S,Pierre V,Delaroche J,Hennebicq S,Grunwald D,Escalier D,Pernet-Gallay K,Jouk PS,Thierry-Mieg N,Toure A,et al.Mutations inDNAH1,which encodes an inner arm heavy chain dynein,lead to male infertilityfrom mμltiple morphological abnormalities of the sperm flagella.Am J HumGenet.2014；94(1):95-104)，该基因编码纤毛轴动力蛋白重链1(dynein axonemal heavychain 1)蛋白。

目前，MMAF的基因突变谱尚未完全发现，基因型和表现型的关系也不明确。目前单基因疾病的研究开始大量采用全外显子组测序(whole-exome sequencing)及全基因组测序(whole-genome sequencing)的方法，这两种方法被成功的应用于发现稀有单基因疾病的致病基因。全外显子组测序及全基因组测序技术已被证明为降低稀有单基因疾病候选基因甚至发现其致病基因的有力、有效手段。仅通过对几个很少的个体(包括患者及正常对照)的全外显子组或基因组进行测序来筛选与疾病相关的变异，其成功率大为提升。因此本领域对MMAF的研究尚不清晰，对造成该疾病的原因更不明了，迫切需要对MMAF的致病机理进行研究，找到新致病基因及突变位点。

发明内容

本发明的第一目的在于提供MMAF生物标记物。

本发明的第二目的在于提供一种检测MMAF的方法。

本发明的第三目的在于提供通过PCR检测CFAP43基因或CFAP43蛋白突变中使用的引物对。

本发明的第四目的在于提供与突变CFAP43基因互补的核酸探针。

本发明的第五目的在于提供检测突变CFAP43基因或CFAP43蛋白的试剂盒。

本发明的第六目的在于提供检测突变CFAP43基因的试剂盒。

本发明通过外显子组测序的方法确定MMAF的致病新基因。

所述MMAF生物标记物为突变的CFAP43基因或CFAP43蛋白，所述生物标记物具有选自如下的突变的CFAP43基因或CFAP43蛋白：

在外显子30中剪接位点缺失突变(c.3661-2A>-)；

在外显子22中无义突变(c.2802T>A；p.C934*)；