[发明专利]DNA探针-菌落原位杂交技术筛选麻痹性贝毒产生菌株的方法有效

专利信息
申请号: 201710865983.9 申请日: 2017-09-22
公开(公告)号: CN107739749B 公开(公告)日: 2021-01-05
发明(设计)人: 张晓玲;杨桥;穆军 申请(专利权)人: 浙江海洋大学
主分类号: C12Q1/6841 分类号: C12Q1/6841;C12Q1/689
代理公司: 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 代理人: 吴秉中
地址: 316000 浙江省舟山市普陀海*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: dna 探针 菌落 原位杂交 技术 筛选 麻痹 性贝毒 产生 菌株 方法
【权利要求书】:

1.DNA探针-菌落原位杂交技术筛选麻痹性贝毒产生菌株的方法,其特征在于,所述的DNA探针为经地高辛标记含有254个碱基序列1所述的单链DNA探针,所述的序列1为:GATGTCTGGACTACGTCCCTCCTACTCGCGCTGTCGAACCTGAATATCGATCCGAGGACGCCGGCTGGGGCTTCGCCGACGCGGGCTCGGCGCGCATGGGCGGCACGTGACTCTCAACGCACGCTGAACGTCGGCAGGACCCTGCAGCACCAAGTCCAGCACCGCACGTTCGTGCAGCAGATCAGCGCCGTTTGAGGGCGAGTTCGCCTCGCATCGCGTCGTGGCAGACGGGATTAGGCAGATCTACAGAAGTC;

所述的DNA探针为通过特定的正向引物17a与反向引物17b,经聚合酶链式反应(PCR)扩增合成了以地高辛标记的单链DNA探针;

所述的方法包括:

1)预处理:制作并固定待测试菌株的DNA;

2)杂交:将待测试菌株的DNA与DNA探针进行杂交作用;

3)筛选:通过显色测试杂交匹配结果。

2.根据权利要求1所述的DNA探针-菌落原位杂交技术筛选麻痹性贝毒产生菌株的方法,其特征在于:所述的正向引物17a,序列为:TAGTAGGAGTAGCACGCTGCA;所述的反向引物17b,序列为:TCCTTCCTRGACCACGA。

3.根据权利要求1所述的DNA探针-菌落原位杂交技术筛选麻痹性贝毒产生菌株的方法,其特征在于:所述的预处理步骤为:制作10cm-12cm×10cm-12cm的硝酸纤维素膜,取待测试菌株单菌落点于硝酸纤维素膜,浸于0.50-0.52MNaOH溶液8-10分钟,取出自然干燥后夹在两张干滤纸之间,放置于真空烤箱中,78-80℃烘2-2.5小时;在TE缓冲液中加入溶菌酶,放入DNA膜,在36-37℃温度下作用30-32分钟后用TE缓冲液漂洗;将DNA膜置于10-12mL杂交缓冲液中,40-42℃温育1.5-2.0小时。

4.根据权利要求1所述的DNA探针-菌落原位杂交技术筛选麻痹性贝毒产生菌株的方法,其特征在于:所述的杂交步骤为:将以地高辛标记的DNA于沸水中煮10-15分钟变性,置冰浴中,取5.0-6.0mL标记DNA加入到2.5-3.0mL杂交缓冲液中,将膜由杂交缓冲液中取出置于塑料薄膜上,加入含地高辛标记DNA探针的杂交缓冲液中,40-42℃下作用2.0-2.5小时;将膜放至盛有2.0-3.0×SSC溶液的平皿内,洗涤2-3次,每次5-6分钟。

5.根据权利要求1所述的DNA探针-菌落原位杂交技术筛选麻痹性贝毒产生菌株的方法,其特征在于:所述的筛选步骤为:将膜放至盛有缓冲液的平皿中洗1-2分钟,弃去洗涤液;加入20-22mL 1.0-1.2%的封闭液,室温放置60-70分钟,弃去溶液;加入20-25mL碱性磷酸酶标记抗地高辛抗体溶液,36-37℃温育30-35分钟,弃去抗体结合物,用冲洗液洗涤3-4次,每次40-50mL;在显色缓冲液中平衡2-3分钟后,倾倒显色缓冲液,将膜置于塑料袋内;加入BCIP/NBT显色液中,置于暗处,待显色后加入TE溶液终止反应,有斑点出现,即表示菌株产毒阳性;无斑点,即表示菌株产毒阴性。

6.根据权利要求3所述的DNA探针-菌落原位杂交技术筛选麻痹性贝毒产生菌株的方法,其特征在于:所述的预处理步骤中的溶菌酶的用量为每毫升TE缓冲液加入4.8-5.2mg溶菌酶;杂交缓冲液为:5×SSC溶液、50-52mM磷酸缓冲液、1.0-1.1mMEDTA、10-12%硫酸葡聚糖、48-50%去离子甲酰胺,pH7.0-7.1。

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