[发明专利]一种快速检测鉴定水稻潜根线虫的LAMP引物和方法有效
申请号: | 201710786901.1 | 申请日: | 2017-09-04 |
公开(公告)号: | CN107502662B | 公开(公告)日: | 2021-07-09 |
发明(设计)人: | 徐春玲;刘淑婷;韩玉春;丁善文;赵立荣;谢辉 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6848 | 分类号: | C12Q1/6848;C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 任重 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 检测 鉴定 水稻 线虫 lamp 引物 方法 | ||
1.一种快速检测水稻潜根线虫的LAMP引物组在检测水稻潜根线虫的应用,其特征在于,所述LAMP引物组由外引物对Ho-F3和Ho-B3,以及内引物对Ho-FIP和Ho-BIP组成,
Ho-F3的序列为:5’-ATCTTGTCCTTTGGCACG-3’,
Ho-B3的序列为:5’-CGGTTGAACAAACAACGT-3’,
Ho-FIP的序列为:5’-CAGCATAGCAACAGAATGAATTCACGGTCGTAAACCTAATACGCG-3’,
Ho-BIP的序列为:5’-TTGTACTACAATGGATTGTTTTCGCCTGATCCATCCACCCATG-3’。
2.权利要求1所述LAMP引物组在制备水稻潜根线虫的检测试剂盒中的应用。
3.一种快速检测水稻潜根线虫的LAMP方法,其特征在于,以待测样本DNA为模板,利用权利要求1所述LAMP引物组进行LAMP扩增;所述LAMP扩增的反应体系为:10×ThermopolBuffer 2.5μL、引物25倍混合液2μL、10 mmol/L dNTPs 3.5μL、100 mmol/L MgSO4 1.5μL、8U/μLBst DNA聚合酶1μL、模板DNA 1μL、ddH2O补足25μL;其中,引物25倍混合液为40μM引物Ho-FIP、40μM引物Ho-BIP、5μM引物Ho-F3、5μM引物Ho-B3;所述LAMP扩增的反应条件为:57℃温育45 min,85℃保温5 min。
4.根据权利要求3所述的LAMP方法,其特征在于,LAMP扩增的结果判定方法为琼脂糖凝胶电泳法或SYBR Green I染色目测法:所述琼脂糖凝胶电泳法为:将LAMP扩增产物使用1%琼脂糖凝胶5~10 V/cm电压下电泳25 min,若出现LAMP特征性阶梯状条带,则判定为样本中有水稻潜根线虫;所述SYBR Green I染色目测法为:在 LAMP 扩增产物中加入SYBRGreen I染料,若观察到绿色荧光,判定为样本中有水稻潜根线虫。
5.一种快速检测水稻潜根线虫的LAMP试剂盒,其特征在于,包含有权利要求1所述LAMP引物组。
6.根据权利要求5所述LAMP试剂盒,其特征在于,还含有SYBR Green I染料。
7.根据权利要求6所述LAMP试剂盒,其特征在于,还含有10×Thermopol Buffer、10mmol/L dNTPs、100 mmol/L MgSO4、8U/μLBst DNA 聚合酶、ddH2O。
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