[发明专利]北极苹果特异性实时荧光PCR检测引物、探针、方法和试剂盒有效
申请号: | 201710730992.7 | 申请日: | 2017-08-23 |
公开(公告)号: | CN107475391B | 公开(公告)日: | 2020-11-13 |
发明(设计)人: | 刘二龙;卢丽;吕英姿;蒋湘;李嘉琪;林先准 | 申请(专利权)人: | 黄埔出入境检验检疫局综合技术服务中心 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星 |
地址: | 510000 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 北极 苹果 特异性 实时 荧光 pcr 检测 引物 探针 方法 试剂盒 | ||
1.一种北极苹果特异性实时荧光PCR检测引物组,包括检测引物和检测探针,其特征在于,所述的检测引物如下所示:
Arctic-F:5’-TGACCCGAACCAGACCCAC-3’;
Arctic-R:5’-CAGGATTCAATCTTAAGAAACTTTATTG-3’;
所述的检测探针如下所示:
Arctic-P:5’-TAACTTCTACTCCGCGGCTCGATCG-3’,探针的5’端标记有荧光报告基团,3'端标记有荧光淬灭基团;
所述的荧光报告基团为FAM,所述的荧光淬灭基团为BHQ1。
2.一种北极苹果特异性实时荧光PCR检测试剂盒,包括实时荧光定量PCR反应液、耐热DNA聚合酶、检测引物和检测探针,其特征在于,所述的检测引物如下所示:
Arctic-F:5’-TGACCCGAACCAGACCCAC-3’;
Arctic-R:5’-CAGGATTCAATCTTAAGAAACTTTATTG-3’;
所述的检测探针如下所示:
Arctic-P:5’-TAACTTCTACTCCGCGGCTCGATCG-3’,探针的5’端标记有荧光报告基团,3'端标记有荧光淬灭基团。
3.一种北极苹果特异性实时荧光PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取样品的基因组DNA作为模板;
(2)加入权利要求1所述的检测引物和检测探针,与实时荧光定量PCR反应液及耐热DNA聚合酶混合形成扩增反应体系;
(3)将扩增反应体系在荧光PCR仪上进行实时荧光PCR反应,反应结束后,根据扩增曲线判断样品是否为北极苹果;
所述的步骤(3)的根据扩增曲线判断样品是否为北极苹果的标准为:如果扩增曲线有典型荧光扩增曲线,则说明样品为北极苹果;如果扩增曲线无典型荧光扩增曲线,则说明样品不是北极苹果。
4.根据权利要求3所述的北极苹果特异性实时荧光PCR检测方法,其特征在于,所述的步骤(2)的扩增反应体系为:25 μL,包括Premix Ex Taq 12.5 μL,ROX Reference Dye II0.2 μL,10 μmol/L 检测引物Arctic-F和Arctic-R各0.5 μL,10 μmol/L 检测探针Arctic-P 0.5 μL,DNA 模板2 μL和ddH2O 8.8 μL;所述的步骤(3)的实时荧光PCR反应,其反应程序为95℃ 30 s;95℃ 5 s、60℃ 34 s,40个循环,于60℃收集荧光信号。
5.一种北极苹果特异性实时荧光PCR定量检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取北极苹果的基因组DNA进行梯度稀释以用作不同起始浓度的模板,分别加入权利要求1所述的检测引物和检测探针,与实时荧光定量PCR反应液及耐热DNA聚合酶混合形成扩增反应体系,在荧光PCR仪上进行实时荧光PCR反应;
(2)反应后得到各起始浓度模板对应的Ct值,该Ct值与起始模板量的常用对数(lg)呈线性关系,据此得到该线性范围内北极苹果的标准曲线;
(3)提取待测样品的基因组DNA为模板,加入与步骤(1)中相同体系的权利要求1所述的检测引物和检测探针,与实时荧光定量PCR反应液及耐热DNA聚合酶混合形成扩增反应体系,在荧光PCR仪上进行实时荧光PCR反应,反应后得到Ct值,将其代入步骤(2)获得的北极苹果的标准曲线方程,计算得到待检样品中北极苹果基因组DNA的含量。
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