[发明专利]一种用于染色体异常检测的文库构建方法及试剂盒在审

专利信息
申请号: 201710650277.2 申请日: 2017-08-01
公开(公告)号: CN107217310A 公开(公告)日: 2017-09-29
发明(设计)人: 洪燕;白金蕾;玄兆伶;李大为;梁峻彬;陈重建 申请(专利权)人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 100176 北京市大兴区北京经济*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 染色体 异常 检测 文库 构建 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种用于染色体异常检测的文库构建方法,该方法包括:

步骤A:提取样本gDNA,获得gDNA;

步骤B:将所述gDNA进行酶切处理,纯化,获得酶切产物;

步骤C:将所述酶切产物进行末端修复,纯化,得到平末端DNA片段;

步骤D:将所述平末端DNA片段进行3'端加A,得到3'端加A的DNA片段;

步骤E:将所述3'端加A的DNA片段进行加接头,纯化,得到加接头的DNA片段;

步骤F:将所述加接头的DNA片段进行PCR扩增,纯化,得到扩增产物;

其中,步骤B中所述的酶切处理使用的酶为dsDNA Fragmentase;

步骤C中所述末端修复使用试剂包括:1μL T4 DNA聚合酶,1μL T4多聚核苷酸激酶、5μL 10×多聚核苷酸激酶缓冲液及1μL dNTP;

步骤D中所述3'端加A使用试剂包括:0.5μL Klenow片段(3'-5'exo-)、2.5μL dATP及2.5μL 10×缓冲液;

步骤F中所述PCR扩增的扩增引物包括:

Ann引物序列(SEQ ID NO:1):

5'-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGAC-3'

Index引物序列(SEQ ID NO:2):

5'-CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATANNNNNNNGTGACTGGAGTTC-3';

其中,N为随机碱基。

2.根据权利要求1所述的文库构建方法,其特征在于,所述步骤A中样本为羊水、脐血、全血、组织中任意一种。

3.根据权利要求1所述的文库构建方法,其特征在于,所述步骤B中gDNA的量为8~15ng。

4.根据权利要求1所述的文库构建方法,其特征在于,所述步骤B的酶切处理的条件为37℃50分钟。

5.根据权利要求1所述的文库构建方法,其特征在于,所述步骤C的末端修复的条件为20℃30分钟。

6.根据权利要求1所述的文库构建方法,其特征在于,所述步骤D的3'端加A的反应条件为37℃30分钟。

7.根据权利要求1所述的文库构建方法,其特征在于,所述步骤F的PCR扩增条件为94℃预变性2分钟、(94℃变性15秒、62℃退火30秒、72℃延伸30秒)17个循环、72℃延伸10分钟、4℃保存。

8.一种用于染色体异常检测的文库构建试剂盒,其用于实施权利要求1~7中任一项所述的文库构建方法,其包括:

用于所述酶切处理的试剂;

用于所述末端修复的试剂;

用于所述3'端加A的试剂;

用于所述加接头的试剂;

用于所述PCR扩增的试剂;

用于所述纯化的试剂。

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