[发明专利]一种用于染色体异常检测的文库构建方法及试剂盒在审
申请号: | 201710650277.2 | 申请日: | 2017-08-01 |
公开(公告)号: | CN107217310A | 公开(公告)日: | 2017-09-29 |
发明(设计)人: | 洪燕;白金蕾;玄兆伶;李大为;梁峻彬;陈重建 | 申请(专利权)人: | 安诺优达基因科技(北京)有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06 |
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地址: | 100176 北京市大兴区北京经济*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 染色体 异常 检测 文库 构建 方法 试剂盒 | ||
1.一种用于染色体异常检测的文库构建方法,该方法包括:
步骤A:提取样本gDNA,获得gDNA;
步骤B:将所述gDNA进行酶切处理,纯化,获得酶切产物;
步骤C:将所述酶切产物进行末端修复,纯化,得到平末端DNA片段;
步骤D:将所述平末端DNA片段进行3'端加A,得到3'端加A的DNA片段;
步骤E:将所述3'端加A的DNA片段进行加接头,纯化,得到加接头的DNA片段;
步骤F:将所述加接头的DNA片段进行PCR扩增,纯化,得到扩增产物;
其中,步骤B中所述的酶切处理使用的酶为dsDNA Fragmentase;
步骤C中所述末端修复使用试剂包括:1μL T4 DNA聚合酶,1μL T4多聚核苷酸激酶、5μL 10×多聚核苷酸激酶缓冲液及1μL dNTP;
步骤D中所述3'端加A使用试剂包括:0.5μL Klenow片段(3'-5'exo-)、2.5μL dATP及2.5μL 10×缓冲液;
步骤F中所述PCR扩增的扩增引物包括:
Ann引物序列(SEQ ID NO:1):
5'-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGAC-3'
Index引物序列(SEQ ID NO:2):
5'-CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATANNNNNNNGTGACTGGAGTTC-3';
其中,N为随机碱基。
2.根据权利要求1所述的文库构建方法,其特征在于,所述步骤A中样本为羊水、脐血、全血、组织中任意一种。
3.根据权利要求1所述的文库构建方法,其特征在于,所述步骤B中gDNA的量为8~15ng。
4.根据权利要求1所述的文库构建方法,其特征在于,所述步骤B的酶切处理的条件为37℃50分钟。
5.根据权利要求1所述的文库构建方法,其特征在于,所述步骤C的末端修复的条件为20℃30分钟。
6.根据权利要求1所述的文库构建方法,其特征在于,所述步骤D的3'端加A的反应条件为37℃30分钟。
7.根据权利要求1所述的文库构建方法,其特征在于,所述步骤F的PCR扩增条件为94℃预变性2分钟、(94℃变性15秒、62℃退火30秒、72℃延伸30秒)17个循环、72℃延伸10分钟、4℃保存。
8.一种用于染色体异常检测的文库构建试剂盒,其用于实施权利要求1~7中任一项所述的文库构建方法,其包括:
用于所述酶切处理的试剂;
用于所述末端修复的试剂;
用于所述3'端加A的试剂;
用于所述加接头的试剂;
用于所述PCR扩增的试剂;
用于所述纯化的试剂。
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