[发明专利]PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型及其构建方法和构建系统在审
申请号: | 201710576979.0 | 申请日: | 2017-07-14 |
公开(公告)号: | CN109504750A | 公开(公告)日: | 2019-03-22 |
发明(设计)人: | 戴勇;眭维国;吴炎;杜冬;甘晴;曾君 | 申请(专利权)人: | 戴勇;眭维国;甘晴;吴炎 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C40B50/06 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 何平 |
地址: | 541000 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 构建 差异性表达 图谱模型 围手术期 环状RNA 肝移植 移植术 差异数据 对比数据 构建系统 疾病 肝功能恢复 外周血标本 微阵列芯片 数据分析 特异表达 早期诊断 提取RNA 表达谱 预后 筛查 相异 脱离 治疗 分析 健康 | ||
一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型及其构建方法和构建系统,其中,构建方法包括如下步骤:设置疾病组与对照组,每组包括若干份相异人体的已经脱离人体的外周血标本;分别提取RNA;采用circRNA微阵列芯片分析疾病组和对照组RNA溶液中的circRNA表达谱,得到circRNA差异数据;采用RT‑PCR验证疾病组和对照组中circRNA的表达情况,得到对比数据;对circRNA差异数据及对比数据进行数据分析,构建PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型。上述构建方法,通过比较未实施肝移植术前患者与实施肝移植术后患者、健康对照者之间差异性表达的circRNA,筛查PLC特异表达的circRNA以及移植术后早期肝功能恢复相关的circRNA,为PLC早期诊断、预后以及治疗提供新的信息。
技术领域
本发明涉及生物医学技术领域,特别是涉及一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型及其构建方法和构建系统。
背景技术
原发性肝癌(Primary Liver Cancer,PLC)是我国最常见的肝脏恶性肿瘤,该病临床表现复杂,好发于40至50岁的男性,由多种因素相互影响,例如包括微量元素的化学元素、环境因素和病毒感染,所以其发病机制复杂一直未能阐明,这也给PLC的治疗带来了困难。目前肝移植是治疗PLC最有效、最彻底的方法,它将肝脏整个癌变组织切除,换上匹配的健康肝脏组织,使肿瘤尽可能得到清除以及减少复发,同时也有助于肝功能的恢复。由于肝移植是异体移植,不可避免的,患者或多或少会产生免疫排斥反应,保守估计,大约10%的患者可发展为慢性排斥反应。
环状RNA(circular RNA,circRNA)作为最近被发现的一种特殊的新型内源非编码RNA,是RNA研究领域的研究热点。生物体内普遍存在着不能翻译为蛋白的功能性RNA分子,称为非编码RNA(non-coding RNAs,ncRNAs)。其中circRNA是一类通过反向剪接将3′和5′末端连接起来形成的环形RNA分子。按照剪接来源的不同,circRNA可分为内含子来源环状RNA以及外显子来源环状RNA,主要参与转录及转录后基因表达的调节。circRNA可能在疾病的发生和发展中发挥着重要的作用,有望成为某些疾病过程的潜在的生物标志物。围绕环状RNA进行深入而系统的研究具有较强的创新与现实性意义。
同种异体肝移植是目前治疗PLC最彻底、有效的方法,但如何提高供肝利用率和受者生存率一直也是医疗界所面临的问题。因此,迫切需要发现用于PLC早期诊断和肝移植术后功能恢复相关的新生物标记物。
发明内容
基于此,有必要提供一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型及其构建方法和构建系统。
一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型的构建方法,包括如下步骤:设置疾病组与对照组,每组包括若干份相异人体的已经脱离人体的外周血标本;分别提取各所述外周血标本中的RNA,得到RNA溶液;采用circRNA微阵列芯片分析疾病组和对照组RNA溶液中的circRNA表达谱,得到circRNA差异数据;采用RT-PCR验证疾病组和对照组中circRNA的表达情况,得到对比数据;对circRNA差异数据及对比数据进行数据分析,构建PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型。
一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型,由如上任一实施例中所述的构建方法制备得到。
一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型的构建系统,采用如上任一实施例中所述的构建方法实现。
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