[发明专利]PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型及其构建方法和构建系统在审

专利信息
申请号: 201710576979.0 申请日: 2017-07-14
公开(公告)号: CN109504750A 公开(公告)日: 2019-03-22
发明(设计)人: 戴勇;眭维国;吴炎;杜冬;甘晴;曾君 申请(专利权)人: 戴勇;眭维国;甘晴;吴炎
主分类号: C12Q1/686 分类号: C12Q1/686;C40B50/06
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 代理人: 何平
地址: 541000 广西壮族*** 国省代码: 广西;45
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摘要:
搜索关键词: 构建 差异性表达 图谱模型 围手术期 环状RNA 肝移植 移植术 差异数据 对比数据 构建系统 疾病 肝功能恢复 外周血标本 微阵列芯片 数据分析 特异表达 早期诊断 提取RNA 表达谱 预后 筛查 相异 脱离 治疗 分析 健康
【说明书】:

一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型及其构建方法和构建系统,其中,构建方法包括如下步骤:设置疾病组与对照组,每组包括若干份相异人体的已经脱离人体的外周血标本;分别提取RNA;采用circRNA微阵列芯片分析疾病组和对照组RNA溶液中的circRNA表达谱,得到circRNA差异数据;采用RT‑PCR验证疾病组和对照组中circRNA的表达情况,得到对比数据;对circRNA差异数据及对比数据进行数据分析,构建PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型。上述构建方法,通过比较未实施肝移植术前患者与实施肝移植术后患者、健康对照者之间差异性表达的circRNA,筛查PLC特异表达的circRNA以及移植术后早期肝功能恢复相关的circRNA,为PLC早期诊断、预后以及治疗提供新的信息。

技术领域

发明涉及生物医学技术领域,特别是涉及一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型及其构建方法和构建系统。

背景技术

原发性肝癌(Primary Liver Cancer,PLC)是我国最常见的肝脏恶性肿瘤,该病临床表现复杂,好发于40至50岁的男性,由多种因素相互影响,例如包括微量元素的化学元素、环境因素和病毒感染,所以其发病机制复杂一直未能阐明,这也给PLC的治疗带来了困难。目前肝移植是治疗PLC最有效、最彻底的方法,它将肝脏整个癌变组织切除,换上匹配的健康肝脏组织,使肿瘤尽可能得到清除以及减少复发,同时也有助于肝功能的恢复。由于肝移植是异体移植,不可避免的,患者或多或少会产生免疫排斥反应,保守估计,大约10%的患者可发展为慢性排斥反应。

环状RNA(circular RNA,circRNA)作为最近被发现的一种特殊的新型内源非编码RNA,是RNA研究领域的研究热点。生物体内普遍存在着不能翻译为蛋白的功能性RNA分子,称为非编码RNA(non-coding RNAs,ncRNAs)。其中circRNA是一类通过反向剪接将3′和5′末端连接起来形成的环形RNA分子。按照剪接来源的不同,circRNA可分为内含子来源环状RNA以及外显子来源环状RNA,主要参与转录及转录后基因表达的调节。circRNA可能在疾病的发生和发展中发挥着重要的作用,有望成为某些疾病过程的潜在的生物标志物。围绕环状RNA进行深入而系统的研究具有较强的创新与现实性意义。

同种异体肝移植是目前治疗PLC最彻底、有效的方法,但如何提高供肝利用率和受者生存率一直也是医疗界所面临的问题。因此,迫切需要发现用于PLC早期诊断和肝移植术后功能恢复相关的新生物标记物。

发明内容

基于此,有必要提供一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型及其构建方法和构建系统。

一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型的构建方法,包括如下步骤:设置疾病组与对照组,每组包括若干份相异人体的已经脱离人体的外周血标本;分别提取各所述外周血标本中的RNA,得到RNA溶液;采用circRNA微阵列芯片分析疾病组和对照组RNA溶液中的circRNA表达谱,得到circRNA差异数据;采用RT-PCR验证疾病组和对照组中circRNA的表达情况,得到对比数据;对circRNA差异数据及对比数据进行数据分析,构建PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型。

一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型,由如上任一实施例中所述的构建方法制备得到。

一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型的构建系统,采用如上任一实施例中所述的构建方法实现。

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