[发明专利]PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型及其构建方法和构建系统在审
申请号: | 201710576979.0 | 申请日: | 2017-07-14 |
公开(公告)号: | CN109504750A | 公开(公告)日: | 2019-03-22 |
发明(设计)人: | 戴勇;眭维国;吴炎;杜冬;甘晴;曾君 | 申请(专利权)人: | 戴勇;眭维国;甘晴;吴炎 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C40B50/06 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 何平 |
地址: | 541000 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 构建 差异性表达 图谱模型 围手术期 环状RNA 肝移植 移植术 差异数据 对比数据 构建系统 疾病 肝功能恢复 外周血标本 微阵列芯片 数据分析 特异表达 早期诊断 提取RNA 表达谱 预后 筛查 相异 脱离 治疗 分析 健康 | ||
1.一种PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
设置疾病组与对照组,每组包括若干份相异人体的已经脱离人体的外周血标本;
分别提取各所述外周血标本中的RNA,得到RNA溶液;
采用circRNA微阵列芯片分析疾病组和对照组RNA溶液中的circRNA表达谱,得到circRNA差异数据;
采用RT-PCR验证疾病组和对照组中circRNA的表达情况,得到对比数据;
对circRNA差异数据及对比数据进行数据分析,构建PLC围手术期肝移植患者环状RNA差异性表达谱图谱模型。
2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,分别提取各所述外周血标本中的RNA,得到RNA溶液,具体为:
各取2ml外周血标本,加入1mL TRIzol,用移液管反复吹打多次,得到第一样品;
将第一样品于15℃~30℃放置5min后,加入0.2mL的氯仿,震荡15s后,15℃~30℃孵育2min~3min;
4℃,12,000g离心15min,吸取上层水相;
将水相转移到新离心管中,加入异丙醇,混匀后15℃~30℃孵育10min,得到第二样品,其中,异丙醇的加入量为制备第一样品时加入Trizol试剂量的1/2;
将第二样品于4℃,12,000g离心10min,使RNA形成RNA沉淀,弃上清;
加入75%乙醇,振荡混匀后,4℃,7500g离心5min,弃上清;
将RNA沉淀干燥;
加入无RNA酶的水溶解RNA沉淀,55℃~60℃孵育10min,得到总RNA溶液。
3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,分别提取各所述外周血标本中的RNA,得到RNA溶液,具体为:
将外周血标本使用淋巴分离液分离出单个核细胞;
向单个核细胞沉淀中加入TRIzol,用移液管反复吹打多次,得到第一样品;
将第一样品于15℃~30℃放置5min后,加入0.2mL的氯仿,震荡15s后,15℃~30℃孵育2min~3min;
4℃下12,000g离心15min,吸取上层水相;
将水相转移到新离心管中,加入异丙醇,混匀后15℃~30℃孵育10min,得到第二样品,其中,异丙醇的加入量为制备第一样品时加入Trizol试剂量的1/2;
将第二样品于4℃,12,000g离心10min,使RNA形成RNA沉淀,弃上清;
加入75%乙醇,振荡混匀后,4℃,7500g离心5min,弃上清;
将RNA沉淀干燥;
加入无RNA酶的水溶解RNA沉淀,55℃~60℃孵育10min,得到总RNA溶液。
4.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,在分别提取各所述外周血标本中的RNA,得到RNA溶液之后,以及在采用circRNA微阵列芯片分析疾病组和对照组RNA溶液中的circRNA表达谱,得到circRNA差异数据之前,所述构建方法还包括如下步骤:
对总RNA进行纯化,并测定总RNA中RNA含量。
5.根据权利要求4所述的构建方法,其特征在于,在对总RNA进行纯化,并测定总RNA中RNA含量之后,以及在采用circRNA微阵列芯片分析疾病组和对照组RNA溶液中的circRNA表达谱,得到circRNA差异数据之前,所述构建方法还包括如下步骤:
检测纯化后的总RNA是否合格,是则执行后续步骤,其中,总RNA合格的标准为OD260/OD280比值应为1.8~2.1,且OD260/OD230比值要大于1.8。
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