[发明专利]一种检测人EGFR基因突变的液相芯片在审
申请号: | 201710575216.4 | 申请日: | 2017-07-14 |
公开(公告)号: | CN107619864A | 公开(公告)日: | 2018-01-23 |
发明(设计)人: | 姬宏超;胡东雄;万艳娟 | 申请(专利权)人: | 广州赛百纯生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
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地址: | 510000 广东省广州*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 egfr 基因突变 芯片 | ||
1.用于人EGFR突变检测的条形码磁珠,其特征包括:
(1)条形码磁珠的尺寸70umx30umx5 um ,码磁珠不带任何核苷酸序列,PCR扩增时条码磁珠之间无任何反应和干扰,可以实现在一个反应孔内对多个项目的检测;
(2) 包被探针的微球来源于BMB ID NO.1~60任意一种,使用检测外显子18突变的磁珠选自 BMB ID NO.1~10,检测外显子19突变的磁珠选自BMB ID NO.11~40,检测外显子20突变的磁珠选自BMB ID NO.41~51,检测外显子21突变的磁珠选自BMB ID NO.52~60.针对EGFR扩增外显子18、19、20、21野生型和突变型设计的引物及探针,野生型和突变型设计探针的5’有NH2修饰。
2.用于人EGFR突变检测的扩增引物序列,其特征在于:
检测外显子18时扩增的引物序列选自SEQ.ID.NO.1~4中一种以上序列,检测外显子19时扩增的引物选自序列SEQ.ID.NO.17~20中一种以上序列, 检测外显子20时扩增的引物选自序列SEQ.ID.NO.81~84中一种以上序列, 检测外显子21时扩增的引物选自序列SEQ.ID.NO.115~118中一种以上序列。
3.根据权利2所述,扩增EGFR exon 18序列的引物来源于SEQ.ID.NO.1~4其中的2条或4条,扩增EGFR exon 19序列的引物来源于SEQ.ID.NO.17~20其中的2条或4条,扩增EGFR exon 20序列的引物来源于SEQ.ID.NO.81~84其中的2条或4条,扩增EGFR exon 21序列的引物来源于SEQ.ID.NO.115~118其中的2条或4条。
4.用于人EGFR突变检测的探针序列,其特征在于:
检测外显子18上的突变位点的探针序列来源于SEQ.ID.NO.5~16中一种以上序列, 检测外显子19上的突变位点的探针序列来源于SEQ.ID.NO.21~80中一种以上序列, 检测外显子20上的突变位点的探针序列来源于SEQ.ID.NO.81~114中一种以上序列, 检测外显子21上的突变位点的探针序列来源于SEQ.ID.NO.119~130中一种以上序列;以上特异性探针序列的3’端的最后1~6个碱基中的一个或几个为突变碱基,上述所有的特异性引物的TM值60~66之间。
5.根据权利4要求,检测人EGFR突变的探针序列设计,其特异性从3’端的-2位碱基位错配碱基。
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