[发明专利]蜂房蜜蜂球菌TaqMan荧光定量PCR检测方法在审
| 申请号: | 201710563000.6 | 申请日: | 2017-07-11 |
| 公开(公告)号: | CN107190081A | 公开(公告)日: | 2017-09-22 |
| 发明(设计)人: | 何晓杰;王科珂;苏娃;王振宝;叶尔保勒;艾山江·塔斯坦;皮志媛;陈霞;李胜;阿斯喀·夏热甫汉;叶尔兰·阿不都买金;哈森 | 申请(专利权)人: | 伊犁职业技术学院;新疆出入境检验检疫局检验检疫技术中心;伊犁出入境检验检疫局综合技术服务中心 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/01 |
| 代理公司: | 北京国坤专利代理事务所(普通合伙)11491 | 代理人: | 黄耀钧 |
| 地址: | 835000 新疆*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 蜂房 蜜蜂 球菌 taqman 荧光 定量 pcr 检测 方法 | ||
1.一种蜂房蜜蜂球菌TaqMan荧光定量PCR检测方法,其特征在于,所述蜂房蜜蜂球菌TaqMan荧光定量PCR检测方法包括以下步骤:
步骤一,将M.pluton基因组DNA进行普通PCR扩增,获得大小为157bp的目的片段,PCR产物经回收、克隆、转化、普通PCR和测序鉴定后作同源性比对,与GenBank中登录序列同源性达到100%;将构建的pXT-16S重组质粒标准品用微量紫外分光光度计测定OD260nm/OD280nm=1.92,计算其浓度为1.0×108拷贝/μL;
步骤二,应用矩阵法对荧光定量PCR的引物、探针浓度和退火温度进行优化后的反应参数为:10×PCRbuffer 2.5μL,MgCl21.5μL,dNTPs2μL,上下游引物各1μL,特异性探针0.5μL,Taq DNA聚合酶0.5μL,模板DNA 1μL,加灭菌ddH2O至25μL;优化后的反应条件为:92℃3min;92℃10s、60℃30s,40个循环,60℃时收集荧光信号。
2.如权利要求1所述的蜂房蜜蜂球菌TaqMan荧光定量PCR检测方法,其特征在于,所述F/R上下游引物的序列为SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2。
3.如权利要求1所述的蜂房蜜蜂球菌TaqMan荧光定量PCR检测方法,其特征在于,所述探针的序列为SEQ ID NO:3。
4.如权利要求1所述的蜂房蜜蜂球菌TaqMan荧光定量PCR检测方法,其特征在于,所述蜂房蜜蜂球菌TaqMan荧光定量PCR检测方法具体包括以下步骤:
DNA抽提:采用CTAB法或煮沸法或其它常规DNA抽提方法提取样品、阳性对照、阴性对照中的DNA;
对照设置:蜂房蜜蜂球菌或含有目的DNA片段的阳性质粒作为阳性对照、健康蜜蜂幼虫DNA作为阴性对照,同时设立无模板空白对照;
PCR反应体系配置:在PCR管中加入10×PCRbuffer 2.5μL,MgCl21.5μL,dNTPs 2.0μL,上下游引物各1.0μL,特异性探针0.5μL,Taq DNA聚合酶0.5μL,模板DNA 1.0μL,加灭菌ddH2O 15.0μL,使反应总体积为25.0μL;
PCR反应程序:92℃预变性3min;92℃变性10s、60℃退火延伸30s,共40个循环,在60℃时收集荧光信号;
结果判定:阴性对照和空白对照无Ct值并且无扩增曲线,阳性对照的Ct值应≤36,并且出现典型的扩增曲线,说明试验为有效试验,否则试验无效;在试验有效的情况下,待测样品无Ct值,并且无扩增曲线,表示样品中无蜂房蜜蜂球菌;待测样品Ct值≤36,并且出现典型的扩增曲线,表示样品中存在蜂房蜜蜂球菌;待测样品Ct值>36的样品重复检测,重复检测结果无Ct值表示样品中无蜂房蜜蜂球菌,重复检测结果有Ct值表示样品中存在蜂房蜜蜂球菌。
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