[发明专利]小麦叶锈菌EST-SSR分子标记的引物组及其检测方法和应用有效
| 申请号: | 201710494404.4 | 申请日: | 2017-06-26 |
| 公开(公告)号: | CN107058602B | 公开(公告)日: | 2020-01-21 |
| 发明(设计)人: | 杨文香;王志;张娜;刘大群 | 申请(专利权)人: | 河北农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 13120 石家庄国为知识产权事务所 | 代理人: | 申超平 |
| 地址: | 071001 *** | 国省代码: | 河北;13 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 小麦 锈菌 est ssr 分子 标记 引物 及其 检测 方法 应用 | ||
1.一种小麦叶锈菌EST-SSR分子标记的引物组,其特征在于,所述引物组包括核苷酸序列SEQ ID No:1~74所示引物。
2.利用权利要求1所述的小麦叶锈菌EST-SSR分子标记的引物组对叶锈菌遗传多样性的检测方法,其特征在于,至少包括如下步骤:
(1)小麦叶锈菌全基因组DNA提取;
(2)PCR扩增:94℃预变性5min,然后94℃变性30s,55-59℃退火1min,72℃延伸1min,进行35个循环,72℃延伸2min,10℃保存;
(3)聚丙烯酰胺凝胶电泳检测:取扩增产物,加入变性载样指示剂,在浓度为10%的聚丙烯酰胺凝胶中电泳分离,300V恒压电泳0.8-1.2h,然后银染显色;
(4)小麦叶锈菌遗传多样性检测:构建ESR-SSR标记0、1矩阵,用NTSYS–pc 2.10e软件进行非加权平均聚类分析。
3.如权利要求2所述的对叶锈菌遗传多样性的检测方法,其特征在于,所述PCR扩增体系为:模板DNA 2μL,Taq DNA聚合酶1U,dNTPs 1.0mmol/L,上下游引物各1.5μL,1×PCR缓冲液,用无菌蒸馏水补充反应体系至25.0μL。
4.如权利要求2所述的对叶锈菌遗传多样性的检测方法,其特征在于,所述电泳所用的缓冲液为0.5×TBE。
5.如权利要求2所述的对叶锈菌遗传多样性的检测方法,其特征在于,所述标记0表示相同迁移位置处无带,所述标记1表示相同迁移位置处有带。
6.如权利要求1所述的小麦叶锈菌EST-SSR分子标记的引物组在检测小麦叶锈菌群体遗传多样性中的应用。
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