[发明专利]用于基因分型检测α+缺失型地中海贫血的引物组及试剂盒在审
申请号: | 201710486950.3 | 申请日: | 2017-06-23 |
公开(公告)号: | CN109112203A | 公开(公告)日: | 2019-01-01 |
发明(设计)人: | 陈治中;卿吉琳 | 申请(专利权)人: | 陈治中 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 向群 |
地址: | 530012 广西壮*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 引物组 地中海贫血 引物序列 基因分型检测 试剂盒 分子生物学领域 试剂盒检测 引物 直观 | ||
1.用于基因分型检测α+缺失型地中海贫血的引物组,包括如下引物对:
上下游引物序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的3.7F/3.7R;
上下游引物序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.3所示的DPAIC-F/DPAIC-R;
上下游引物序列分别如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示的4.2F/4.2R。
2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述检测指以人体体液和/或人体基因组DNA为模板,用所述引物组进行PCR扩增后,将所得扩增产物进行电泳即可获知结果。
3.用于快速检测α+缺失型地中海贫血基因型的试剂盒,包括权利要求1所述的引物组。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述快速检测指,直接以人体体液为PCR反应的模板,用所述引物组进行PCR扩增后,将所得扩增产物进行电泳即可获知结果。
5.根据权利要求2或3所述的试剂盒,其特征在于,还包括用于进行PCR和/或电泳的试剂。
6.根据权利要求2-4任一所述的试剂盒,其特征在于,所述用于进行PCR的试剂包括dNTP、DNA聚合酶、缓冲液、双蒸水、MgCl2;
所述用于进行电泳的试剂包括琼脂糖、蒸馏水、核酸染料;
所述核酸染料选自:EB、GelGreen、SYBR GreenⅠ、GoldView、GelRed和GelGreen。
7.根据权利要求2-5任一所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR的反应体系为:模板1~4μl;各引物:0.1~1μmol/L;MgCl2浓度为1.5~5mM/L;dNTP的浓度为100~500μM/L;DNA聚合酶的浓度为1~4U/反应;
所述PCR的反应体系优选包括下述体积份数的各组分:MightyAmp Taq 0.1-1份、2×MightyAmp Buffer 10份、DPAIC-F/3.7F 0.1-1份、DPAIC-R 0.1-1份、4.2F 0.1-1、4.2R0.1-1份、3.7R 0.1-1份、模板+超纯水 4-9.4份;
所述PCR的反应体系进一步优选包括下述体积份数的各组分:MightyAmp Taq 0.5份、2×MightyAmp Buffer 10份、DPAIC-F/3.7F 0.5份、DPAIC-R 0.3份、4.2F 0.2份、4.2R 0.2份、3.7R 0.2份、模板+超纯水 8.1份;
优选的,所述引物组各引物摩尔浓度比例如下:
DPAIC-F/3.7F∶DPAIC-R∶4.2F∶4.2R∶3.7R=5∶3∶2∶2∶2;
所述PCR的反应程序为:95℃8~12分钟;以95℃15~30秒,60-66℃35~70秒,72℃90-180秒为1个循环,进行30~35个循环;72℃8分钟;
所述PCR的反应程序优选为:95℃5min;以94℃30sec、63℃~65℃45sec~1min、72℃130sec为1个循环,进行32个循环;72℃8min、12℃12sec;
所述电泳指,将所述PCR反应产物置于质量比为0.8~1.5%琼脂糖凝胶中,在5V/cm电压下电泳约40~55分钟;所述琼脂糖凝胶中还添加有体积比0.005%核酸染料。
8.根据权利要求4或7所述的试剂盒,其特征在于,所述模板还包括固定在固体载体上的人体血液、和/或体液、和/或基因组DNA、和/或胚胎遗传物质;
优选地,所述模板可以选自滤纸片干血斑样品、滤纸片干羊水样品、滤纸片干浆膜腔液样品、滤纸片干关节液样品、滤纸片干唾液样品、滤纸片干基因组DNA样品、和/或滤纸片干胚胎遗传物质样品。
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