[发明专利]基于GC-MS联用技术的辛芍组方抗脑缺血再灌注损伤的代谢组学研究方法有效
申请号: | 201710441662.6 | 申请日: | 2017-06-13 |
公开(公告)号: | CN107389842B | 公开(公告)日: | 2020-01-10 |
发明(设计)人: | 巩仔鹏;王爱民;张楠;侯佳;李月婷;李勇军;王永林;兰燕宇;黄勇;郑林;刘亭;陆苑;孙佳;陈思颖;李梅;吴林霖 | 申请(专利权)人: | 贵州医科大学 |
主分类号: | G01N30/86 | 分类号: | G01N30/86;G01N30/02 |
代理公司: | 11411 北京联瑞联丰知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 郑自群 |
地址: | 550025 贵州省*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 gc ms 联用 技术 辛芍组方抗脑 缺血 灌注 损伤 代谢 研究 方法 | ||
1.一种基于GC-MS联用技术的辛芍组方抗脑缺血再灌注损伤的代谢组学研究方法,其特征在于,通过以下步骤实现:
(1)采用GC-MS联用技术检测分析大鼠血清样品及尿液样品:
随机将大鼠分为模型组、假手术组和辛芍组,放入代谢笼中进行观察,期间正常饮食及饮水;各组大鼠按一定剂量,连续给药10天,收集不同时间点的各组大鼠的血清样品和血尿液样品,进行初步处理和保存;然后再次对血清样品进行前处理、尿液样品进行前处理;对大鼠血清和尿液样品进行方法学考察,包括日内精密度考察、日间精密度考察、重复性考察、冻融稳定性考察和QC样本考察,建立GC-MS联用技术检测分析大鼠血清样品及尿液样品的指纹图谱分析方法;
所述的血清样品进行前处理的具体方法为:取解冻后血清样本100μL于1.5mL的EP管中,加入甲醇250μL,涡混3min,冰浴10min,在4℃,10000rpm条件下,离心10min;取血清甲醇萃取液250μL,置GC进样瓶,N2吹干;加50μL的15mg/mL甲氧胺吡啶溶液混匀,在70℃,肟化1h,加50μL衍生化试剂,混匀,在70℃,衍生化1h,冷却后,转移至1.5mLEP管中,在4℃,15000rpm条件下,离心10min,移取上清液至内插管中,供GC-MS分析;
所述的尿液样品进行前处理的具体方法为:取冻存后尿样在室温下解冻,取尿样上清液50μL,加60U的脲酶,涡混30s,在37℃恒温孵育箱中孵化15min,加入180μL的甲醇,混匀,在13000rpm,4℃条件下,离心10min;取200μL上清液至GC进样瓶中,N2吹干;脱水后的样品加入50μL15mg/mL甲氧胺吡啶溶液,涡混30s,培养振荡器中在30℃,200rpm条件下肟化90min;加入有1%的TMCS的MSTFA50μL,涡混30s,在70℃保持60min,放冷,加入120μL正庚烷,涡混30s,转移至1.5mL的EP管中,混匀,在12000rpm,4℃条件下离心10min,取上清液至内插管中,待GC-MS分析;
(2)利用PCA和PLS-DA对数据进行分析,结合SPSS17.0,并利用NIST数据库进行代谢物鉴定找出最终的差异代谢物:
在获得GC-MS数据后,用Agilent MSD Chemstation分析软件将原始数据转换为NetCDF格式,导入基于R编程软件的XCMS的软件进行色谱峰提取、去噪、峰匹配、保留时间的矫正、数据导出、保存,将得到的数据进行峰面积归一化处理,采用修正80%规则去除数据缺失值,将获得的数据进行分析;利用SIMCA-P13.0软件对导入的血清样品数据、尿液样品数据进行模式识别分析,假手术组与模型组采用PCA与PLS-DA方法建模,利用变量重要性投影分析VIP值,结合SPSS17.0进行T检验,按照VIP值>1且T检验时P<0.05的标准,筛选出差异代谢物;
将GC-MS检测总离子流图导入NISTAMDIS软件中,进行解卷积分析,利用NIST11数据库对GC-MS检测的内源性差异代谢物进行定性分析,选择质谱数据库中匹配度大于700的物质,进行分析鉴定,进行去硅烷化反应,得到最终的差异代谢物;
(3)通过MetPA在线分析软件对差异代谢物进行通路分析:
为了探索脑缺血再灌注损伤引起的代谢通路的变化,以及给予辛芍组方后对这些代谢通路的影响,将血清样本及尿样样品筛选出的差异代谢物导入MetPA在线分析软件中进行代谢通路分析;通过代谢通路分析后所得影响值,判断代谢通路在代谢网络中是否具有重要影响。
2.根据权利要求1所述基于GC-MS联用技术的辛芍组方抗脑缺血再灌注损伤的代谢组学研究方法,其特征在于,所述步骤(1)中所述的模型组、假手术组和辛芍组的具体的处理方法为:模型组和辛芍组采用改良的Longa方法成功制备中脑动脉栓塞大鼠模型,缺血1h后进行再灌注,缓慢外拉栓线使其球端回至颈总动脉内,恢复大脑中动脉的供血,中动脉缺血再灌注造模完成后,放回代谢笼中进行饲养;假手术组除不插栓线外,其它步骤均和模型组一致。
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