[发明专利]一种检测BRCA1/2基因突变的引物池及检测方法有效
申请号: | 201710391794.2 | 申请日: | 2017-05-27 |
公开(公告)号: | CN107955835B | 公开(公告)日: | 2021-05-14 |
发明(设计)人: | 李明;吴英松;杨学习;朱安娜;梁志坤;许旭平;刘启祥 | 申请(专利权)人: | 广州市达瑞生物技术股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 禹小明;凌衍芬 |
地址: | 510665 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 brca1 基因突变 引物 方法 | ||
1.一种检测BRCA1/2基因突变的引物组,其特征在于,包括三个引物池,引物池1由42对引物组成,所述42对引物的上下游引物序列依次如SEQ ID NO.1~84所示;引物池2由42对引物组成,所述42对引物的上下游引物序列依次如SEQ ID NO.85~168所示;引物池3由13对引物组成,所述13对引物的上下游引物序列依次如SEQ ID NO.169~194所示。
2.权利要求1所述引物组在制备BRCA1/2基因突变检测试剂盒方面的应用。
3.权利要求1所述引物组在构建包含BRCA1/2基因外显子及可变剪切区的文库方面的应用。
4.一种检测BRCA1/2基因突变的试剂盒,其特征在于,包含权利要求1所述检测BRCA1/2基因突变的引物组。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,还包含PCR反应液、DNA连接酶、引物消化液、连接缓冲液、P1接头序列、特异性接头1-16序列、文库扩增反应液、文库扩增引物、磁珠、75%乙醇和/或无核酸酶水。
6.一种包含BRCA1/2基因外显子及可变剪切区的文库,其特征在于,由如下步骤所述方法制备得到:
S1.分别用权利要求1所述三个引物池进行多重PCR扩增BRCA1/2外显子及可变剪切区;
S2.将三个引物池扩增所得目的片段合在一起,并进行文库构建。
7.根据权利要求6所述文库,其特征在于,由如下步骤所述方法制备得到:
(1)样本DNA提取:对静脉血进行DNA提取得到待测样本DNA;
(2)目的片段扩增:以待测样本DNA为模板,分别利用权利要求1所述三个引物池进行多重PCR反应,得到目的基因DNA片段;
(3)消化引物序列:将步骤(2)中三个引物池扩增所得目的基因DNA片段合在一起,然后与引物消化液混合反应,得到去除已知扩增引物的平末端目的基因DNA片段;
(4)接头连接:将步骤(3)得到的平末端目的基因DNA片段与连接缓冲液、P1接头、特异性接头1-16、DNA连接酶和无核酸酶水混合后进行连接反应,得到接头DNA片段;
(5)纯化连接产物及文库扩增:用磁珠对步骤(4)得到的接头DNA片段进行纯化,去除多余的小片段接头,得到纯化后的接头DNA片段;然后加入文库扩增引物及文库扩增反应液对纯化后的接头DNA片段进行PCR扩增,最后用磁珠对扩增的产物进行纯化,去除多余的大片段和小片段,得到文库。
8.根据权利要求7所述文库,其特征在于,将所述步骤(5)得到的文库稀释到200pmol/L作为测序文库。
9.根据权利要求7所述文库,其特征在于,步骤(5)所述PCR扩增反应体系如下:
10.根据权利要求7所述文库,其特征在于,步骤(5)所述PCR扩增反应条件如下:
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