[发明专利]一种乳液中进行滚环扩增的数字核酸分析方法有效
申请号: | 201710323897.5 | 申请日: | 2017-05-04 |
公开(公告)号: | CN106929598B | 公开(公告)日: | 2019-07-05 |
发明(设计)人: | 蒋健晖;唐丽娟;黄志梅;钟志坚 | 申请(专利权)人: | 湖南融健基因生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
代理公司: | 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 | 代理人: | 李渤;郭广迅 |
地址: | 410021 湖南省长沙市雨花区*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 乳液 进行 扩增 数字 核酸 分析 方法 | ||
1.一种乳液中进行滚环扩增的体外非诊断性的数字核酸分析方法,其特征在于:使用挂锁探针、滚环扩增引物P1和滚环扩增引物P2进行滚环扩增,其中:
所述挂锁探针的寡核苷酸序列为:
p-CCA GAT GTA GCT TGT AAG ATG AAG ATA GCG CAC AAT GGT CGAATT CTC AAC CCCTAC GCG AGA CCC AGT AG;
所述滚环扩增引物P1的寡核苷酸序列为:
Biotin-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGACCATTGTGCGCTATCTTCA;
所述滚环扩增引物P2的寡核苷酸序列为:
Cy5-ATGGTCGAATTCTCAACCCCTA;
所述滚环扩增包括如下步骤:
(1)制备滚环扩增引物结合的磁珠:
用缓冲溶液洗涤链霉亲和素包被的直径0.5~2μm磁珠,将磁珠悬浮在缓冲溶液中,将生物素标记的滚环扩增引物P1加入缓冲溶液中,室温下孵育15~30分钟,然后将磁珠用TE缓冲液洗涤三次,制得滚环扩增引物P1结合的磁珠;
(2)合成环探针溶液:
将挂锁探针和待测核酸在95℃下孵育3分钟后,然后在52℃、47℃、42℃下各孵育30分钟后将混合物冷却至室温,加入连接酶、连接酶反应缓冲液,反应1~3h,然后灭活连接酶,制得环探针溶液;
(3)捕获环探针:将步骤(1)制得的滚环扩增引物P1结合的磁珠加入到步骤(2)中制得的环探针溶液中,放置于摇床,反应0.5~2h,制得捕获环探针的磁珠;
(4)制备乳液:所述乳液包括水相和油相,其中:
a、水相制备:将步骤(3)中已捕获环探针的磁珠、13μL浓度为20μM的滚环扩增引物P2、20μL浓度为10mM的dNTP、2μL浓度为1mg/mL的BSA、4μL浓度为8UμL-1的Bst 2.0Warmstart聚合酶混合均匀,加灭菌超纯水至100μL,制得水相;
b、油相制备:将DC5225C、DC749、Ar20以质量比为40%、30%、30%混合均匀,制得油相;
c、形成乳液:将一个直径3毫米钢珠加入2毫升的反应管中,加入100μL水相和200μL油相,调整组织研磨器的频率为28HZ,研磨时间为5分钟,使其形成水相液滴直径约为3-10μm的稳定乳液;
(5)破乳收集磁珠:在制得乳液的反应管中加入异丙醇,破乳洗涤,离心弃去上清液,收集磁珠;
(6)将步骤(5)收集的磁珠进行显微镜检测,对产生荧光信号的磁珠进行计数;
(7)将步骤(5)收集的磁珠进行流式检测,对产生荧光信号的磁珠进行计数。
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