[发明专利]用于预测肝癌预后的lncRNA标志物在审

专利信息
申请号: 201710303403.7 申请日: 2017-05-02
公开(公告)号: CN106893784A 公开(公告)日: 2017-06-27
发明(设计)人: 杨承刚;宋宏涛;董东 申请(专利权)人: 北京泱深生物信息技术有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G06F19/24
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摘要:
搜索关键词: 用于 预测 肝癌 预后 lncrna 标志
【说明书】:

技术领域

发明属于生物医药领域,涉及用于预测肝癌预后的lncRNA标志物。

背景技术

肝癌是最常见的恶性肿瘤之一,是世界范围内肿瘤导致死亡的主要因素之一。80%的新发肝癌病例出现在发展中国家,肝细胞癌(HCC)是中国癌症死亡的主要原因之一。尽管局部治疗如手术和经导管动脉化学栓塞能够治疗肝癌,但肝癌病人仍有很高的复发率,因此手术对患者生存改善还很有限。目前,血清甲胎蛋白(AFP)的早期筛查及多学科综合治疗的应用,使肝癌的五年生存率有所提高,但由于其恶性生物学特性,其复发率和死亡率仍居高不下,因此如何进行风险评估和监测是一个重要的问题。

肝癌的发生发展是多因素、多步骤的复杂过程,肝癌的发病机制极其复杂,其发生、发展和转移与多种基因的突变、缺失、细胞信号转导通路异常及新生血管异常增生等密切相关,进一步探索肝癌的发病机制,了解其生物学特性,是确定新的肝癌生物标志物及寻找有效治疗靶点的基础。

基因组学研究表明,大约只有1%的基因可转录成有蛋白编码功能的RNA,而大部分则转录成无蛋白编码功能的RNA,即非编码RNA。其中,长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是真核细胞中一类转录本长度大于200个核苷酸,但无或很少具有蛋白编码功能的RNA,曾被认为是基因转录的副产物或“暗物质”,不具有生物学功能。随着lncRNA功能学的进展,越来越多的研究表明lncRNA在人类疾病中发挥重要作用。目前,研究表明lncRNA具有复杂的生物学功能,如与细胞代谢、细胞凋亡、细胞周期、细胞黏附运动等有关,并可通过多种途径如调节DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重构、作为miRNA的前体、mRNA降解、磷酸化作用、蛋白修饰等发挥功能,正如同内源性miRNA研究已取得重要成果一样,lncRNA在疾病诊断和治疗领域代表了另一类重要的分子来源,其研究前景巨大。

多项研究已证实lncRNA在肿瘤领域发挥重要作用,主要体现在肿瘤的发生、发展、浸润、转移及复发等多个方面。目前,在肿瘤组织中发现的异常表达的lncRNA可涉及全身各个系统,分布较为广泛,但是由于lncRNA数量庞大,目前针对lncRNA在癌症领域中的研究仍处在起步阶段。lncRNA影响肿瘤发生和/或发展的机制尚有待进一步揭示,众多针对癌症治疗的潜在靶点也有待于研究者们不断发现。因为lncRNA在肝癌的发生机制中的角色尚未阐明,因此探寻lncRNA肝癌的分子基础具有重要意义。

发明内容

为了弥补现有技术的不足,本发明的目的之一,在于提供一种预测肝癌预后的手段和产品。

本发明的目的之二,提供一种建立肝癌患者预后预测模型的方法。

为了实现上述目的,本发明采用如下技术方案:

本发明提供了lncRNA在制备预测肝癌预后的产品中的应用,所述lncRNA选自MKLN1-AS、RP11-133K1.6、RP1-228H13.5、LRRC3-AS1和AC127904.2中的一种或几种。

进一步,所述产品包括芯片、或试剂盒。其中,所述芯片包括基因芯片;所述试剂盒包括基因检测试剂盒。所述基因芯片包括固相载体以及固定在固相载体的寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针包括用于检测基因表达水平的针对MKLN1-AS、RP11-133K1.6、RP1-228H13.5、LRRC3-AS1和AC127904.2基因的寡核苷酸探针;所述基因检测试剂盒包括用于检测MKLN1-AS、RP11-133K1.6、RP1-228H13.5、LRRC3-AS1和AC127904.2基因表达水平的引物或芯片。

进一步,所述产品包括检测样本中MKLN1-AS、RP11-133K1.6、RP1-228H13.5、LRRC3-AS1或AC127904.2的表达水平的试剂。

进一步,所述试剂选自:

特异性识别MKLN1-AS、RP11-133K1.6、RP1-228H13.5、LRRC3-AS1或AC127904.2的探针;或

特异性扩增MKLN1-AS、RP11-133K1.6、RP1-228H13.5、LRRC3-AS1或AC127904.2的引物。

本发明提供了一种预测肝癌预后的产品,所述产品通过检测MKLN1-AS、RP11-133K1.6、RP1-228H13.5、LRRC3-AS1或AC127904.2表达水平来预测肝癌的预后结果。

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