[发明专利]基于基因型建立用户群组的方法、装置及终端在审
申请号: | 201710285456.0 | 申请日: | 2017-04-27 |
公开(公告)号: | CN107133298A | 公开(公告)日: | 2017-09-05 |
发明(设计)人: | 任勇哲;卞婷;唐元华;徐健 | 申请(专利权)人: | 首度生物科技(苏州)有限公司;苏州首度基因科技有限责任公司 |
主分类号: | G06F17/30 | 分类号: | G06F17/30;G06Q50/00;C12Q1/68 |
代理公司: | 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙)32257 | 代理人: | 杨慧林 |
地址: | 215123 江苏省苏州市工*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 基因型 建立 用户 方法 装置 终端 | ||
技术领域
本发明涉及基因建群的技术领域,尤其涉及一种基于基因型建立用户群组的方法、装置及终端。
背景技术
基因型是一个生物个体的全部基因的总和,决定了生物个体的性状表现,如眼睛的颜色。而多种疾病的发生也与基因型的改变密切相关,肿瘤就是一种最为显著的案例,肿瘤多数是由基因突变引起的。从生物学的意义上来说,基因突变的特征差异是人们最根本的特征差异,目前对于基因突变检测应用最成熟的手段为二代测序技术。二代测序技术又称高通量测序技术,是指通过对个体生物样本进行DNA测序,获得DNA序列,进一步及分析DNA序列发现个体基因变异特征的技术。由于二代测序技术的快速发展和成本降低,基于个体基因组特征的精准医疗已成为趋势。目前二代测序技术已使人们能够掌握自身的基因突变的特征,变异特征又与自身的健康状况密切相关,因此基于共同基因变异特征的交流和风险提示显得尤为必要。
伴随着网络社交的兴盛,出现了一大批针对不同领域的社交应用工具,人们也根据自身的喜好特征利用社交应用工具建立了相应的群组,方便了人们交流工作生活中各种各样的问题。人们一直也都在寻找与自己有共同特征的群体,因而一些疾病患者也加入了针对相应疾病的网络群组,通过群组交流各自的治疗经验和康复心得,产生了积极影响。然而目前的病患群组是一种笼统的划分和聚集,同一种疾病的病因可能各不相同,因而治疗经验也不能相互借鉴。即使看似相似的临床表现,如果发病机制不同而盲目跟随听信他人的个人经验,甚至会产生严重后果。因此个体如果不能充分考虑自身特点而加入较大范围的群组,有一定的健康安全风险。同时由于现有群组局限性的影响,不能对有潜在健康风险的人发出警告建议。已有的病患群体中的成员都是已经身患某种疾病的人群,健康人和不了解自身患有风险的人群一般不会加入,因此这些人不能产生及时的交流警告,这些群组的影响也局限在病患人群。基于以上问题,目前迫切需要开发一种基于基因突变特征建立相应的群组的方法。
发明内容
为解决上述技术问题,本发明目的在于提供一种基于基因型建立用户群组的方法,以解决现有技术中的不能准确加入相同或相似变异的群组、不能有效获得健康提示的问题。
本发明公开了一种基于基因型建立用户群组的方法,包括:采集检测者的基因组序列;基于所述基因组序列获取该所述基因组序列中的基因突变位点的属性信息;基于检测者的所述基因突变位点的属性信息,通过单点突变、多点突变和相似点突变对基因进行划分群组,该群组包括单点同变群组、多点同变群组和相似变异群组。
进一步地,在步骤A中,通过采集检测者的样本以得到基因组序列,所述样本为血液样本、唾液样本或组织样本。
进一步地,步骤B包括:通过采用杂交捕获技术建立测序文库并对该测序文库进行质控;符合预设要求后上机测序并进行标准生物信息流程分析以得出采集者的基因突变位点的属性信息。
进一步地,所述基因突变位点的属性信息包括所述基因突变位点的名称、位置和数量。
进一步地,步骤C包括:单点同变群组的划分或创建、和/或多点同变群组的划分或创建、和/或相似变异群组的划分或创建;单点同变群组的划分或创建,其包括获取检测者单点的基因突变位点的属性信息,通过搜索该突变位点的名称和位置加入对应的群组;若无对应的群组,则可通过该突变位点的名称和位置创建新群组;多点同变群组的划分或创建,其包括获取检测者两点或两点以上的基因突变位点的属性信息,通过搜索两点或两点以上的突变位点的名称和位置加入对应的群组;若无对应的群组,则可通过选取的突变位点的名称和位置创建新群组;相似变异群组的划分或创建,其包括获取检测者单点的基因突变位点的属性信息,继续获取若干个与该单点相近的基因突变位点的属性信息,通过搜索该单点的名称和位置加入对应的群组;若无对应的群组,则可通过选取的突变位点的名称和位置创建新群组。
本发明公开的一种基于基因型建立用户群组的装置,包括样本采集存储单元,用于对采集到的样本进行处理,并存储该样本处理后得到的检测者基因组序列;属性获取单元,用于获取所述基因组序列中的基因突变位点的属性信息,所述属性信息包括所述基因突变位点的名称、位置和数量;分组判断单元,根据获取的所述基因突变位点的属性信息进行分组,对应划分到相应的群组中。
进一步地,所述分组判断单元包括判断单元和分组单元,所述判断单元根据获取的基因突变位点的属性信息判断是否存在对应的群组,若存在,则通过所述分组单元将该属性信息划分到对应的群组。
进一步地,还包括群组创建单元,其用于在所述基因突变位点的属性信息不存在对应的群组时创建新群组。
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