[发明专利]基于基因型建立用户群组的方法、装置及终端在审
申请号: | 201710285456.0 | 申请日: | 2017-04-27 |
公开(公告)号: | CN107133298A | 公开(公告)日: | 2017-09-05 |
发明(设计)人: | 任勇哲;卞婷;唐元华;徐健 | 申请(专利权)人: | 首度生物科技(苏州)有限公司;苏州首度基因科技有限责任公司 |
主分类号: | G06F17/30 | 分类号: | G06F17/30;G06Q50/00;C12Q1/68 |
代理公司: | 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙)32257 | 代理人: | 杨慧林 |
地址: | 215123 江苏省苏州市工*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 基因型 建立 用户 方法 装置 终端 | ||
1.一种基于基因型建立用户群组的方法,其特征在于,包括以下步骤:
A:采集检测者的基因组序列;
B:基于所述基因组序列获取该所述基因组序列中的基因突变位点的属性信息;
C:基于检测者的所述基因突变位点的属性信息,通过单点突变、多点突变和相似点突变对基因进行划分群组,该群组包括单点同变群组、多点同变群组和相似变异群组。
2.根据权利要求1所述的基于基因型建立用户群组的方法,其特征在于:在步骤A中,通过采集检测者的样本以得到基因组序列,所述样本为血液样本、唾液样本或组织样本。
3.根据权利要求1所述的基于基因型建立用户群组的方法,其特征在于:步骤B包括:通过采用杂交捕获技术建立测序文库并对该测序文库进行质控;符合预设要求后上机测序并进行标准生物信息流程分析以得出采集者的基因突变位点的属性信息。
4.根据权利要求1或3所述的基于基因型建立用户群组的方法,其特征在于:所述基因突变位点的属性信息包括所述基因突变位点的名称、位置和数量。
5.根据权利要求1所述的基于基因型建立用户群组的方法,其特征在于:步骤C包括:单点同变群组的划分或创建、和/或多点同变群组的划分或创建、和/或相似变异群组的划分或创建,
-单点同变群组的划分或创建,其包括获取检测者单点的基因突变位点的属性信息,通过搜索该突变位点的名称和位置加入对应的群组;若无对应的群组,则可通过该突变位点的名称和位置创建新群组;
-多点同变群组的划分或创建,其包括获取检测者两点或两点以上的基因突变位点的属性信息,通过搜索两点或两点以上的突变位点的名称和位置加入对应的群组;若无对应的群组,则可通过选取的突变位点的名称和位置创建新群组;
-相似变异群组的划分或创建,其包括获取检测者单点的基因突变位点的属性信息,继续获取若干个与该单点相近的基因突变位点的属性信息,通过搜索该单点的名称和位置加入对应的群组;若无对应的群组,则可通过选取的突变位点的名称和位置创建新群组。
6.一种基于基因型建立用户群组的装置,其特征在于,包括:
-样本采集存储单元,用于对采集到的样本进行处理,并存储该样本处理后得到的检测者基因组序列;
-属性获取单元,用于获取所述基因组序列中的基因突变位点的属性信息,所述属性信息包括所述基因突变位点的名称、位置和数量;
-分组判断单元,根据获取的所述基因突变位点的属性信息进行分组,对应划分到相应的群组中。
7.根据权利要求6所述的基于基因型建立用户群组的装置,其特征在于:所述分组判断单元包括判断单元和分组单元,所述判断单元根据获取的基因突变位点的属性信息判断是否存在对应的群组,若存在,则通过所述分组单元将该属性信息划分到对应的群组。
8.根据权利要求6所述的基于基因型建立用户的群组的装置,其特征在于:还包括群组创建单元,其用于在所述基因突变位点的属性信息不存在对应的群组时创建新群组。
9.根据权利要求6所述的基于基因型建立用户群组的装置,其特征在于:还包括设置单元,所述设置单元包括名称设置单元和公告设置单元,所述名称设置单元根据所述基因突变位点的名称和位置信息设置群组的名称,所述公告设置单元根据所述基因突变位点的属性信息设置相应的群组公告。
10.一种终端,其特征在于:包括权利要求6-9任一项所述的基于基因型建立用户群组的装置。
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