[发明专利]双sgRNA表达质粒及其文库的构建方法有效
申请号: | 201710262042.6 | 申请日: | 2017-04-20 |
公开(公告)号: | CN107090466B | 公开(公告)日: | 2020-02-28 |
发明(设计)人: | 谢震;马大程 | 申请(专利权)人: | 清华大学;北京合生基因科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/66 | 分类号: | C12N15/66;C12N15/113;C12N15/63;C40B40/06;C40B50/06 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;任凤华 |
地址: | 100084 北京市海淀区北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | sgrna 表达 质粒 及其 文库 构建 方法 | ||
1.一种构建双sgRNA表达载体的方法,包括:
(a1)利用golden gate拼装方法,采用IIs型限制性内切酶A、IIs型限制性内切酶E、IIs型限制性内切酶D和IIs型限制性内切酶F将DNA片段与出发载体1进行拼装,得到重组载体1;
所述DNA片段的序列自上游到下游依次含有:所述IIs型限制性内切酶A的识别序列、名称为sgRNA1的sgRNA的间隔RNA的编码序列、IIs型限制性内切酶B的识别序列、IIs型限制性内切酶C的识别序列、名称为sgRNA2的sgRNA的间隔RNA的编码序列、所述IIs型限制性内切酶D的识别序列;
所述出发载体1的序列自上游到下游依次含有启动子1序列、所述IIs型限制性内切酶E的识别序列、筛选标签1的编码序列、所述IIs型限制性内切酶F的识别序列、sgRNA骨架1编码序列;
所述DNA片段与所述出发载体1中,所述IIs型限制性内切酶A切割产生的粘性末端overhang与所述IIs型限制性内切酶E切割产生的粘性末端overhang互补配对;所述IIs型限制性内切酶D切割产生的粘性末端overhang与所述IIs型限制性内切酶F切割产生的粘性末端overhang互补配对;所述IIs型限制性内切酶A切割产生的粘性末端overhang和所述IIs型限制性内切酶E切割产生的粘性末端overhang均不与所述IIs型限制性内切酶D切割产生的粘性末端overhang和所述IIs型限制性内切酶F切割产生的粘性末端overhang互补配对;
(a2)利用golden gate拼装方法,采用IIs型限制性内切酶G、所述IIs型限制性内切酶B、IIs型限制性内切酶H和所述IIs型限制性内切酶C将所述重组载体1与出发载体2进行拼装,得到重组载体2,所述重组载体2即为所述双sgRNA表达载体;
所述出发载体2的序列自上游到下游依次含有:所述IIs型限制性内切酶G的识别序列、sgRNA骨架2编码序列、筛选标签2的编码序列、启动子2序列、所述IIs型限制性内切酶H的识别序列;
所述重组载体1与所述出发载体2中,所述IIs型限制性内切酶G切割产生的粘性末端overhang与所述IIs型限制性内切酶B切割产生的粘性末端overhang互补配对;所述IIs型限制性内切酶H切割产生的粘性末端overhang与所述IIs型限制性内切酶C切割产生的粘性末端overhang互补配对;所述IIs型限制性内切酶G切割产生的粘性末端overhang和所述IIs型限制性内切酶B切割产生的粘性末端overhang均不与所述IIs型限制性内切酶H切割产生的粘性末端overhang和所述IIs型限制性内切酶C切割产生的粘性末端overhang互补配对;
所述IIs型限制性内切酶A、所述IIs型限制性内切酶D、所述IIs型限制性内切酶E和所述IIs型限制性内切酶F均不同于所述IIs型限制性内切酶B和所述IIs型限制性内切酶C;
所述sgRNA骨架1和所述sgRNA骨架2均含有完整sgRNA中除间隔RNA外的功能片段;
所述IIs型限制性内切酶A、所述IIs型限制性内切酶D、所述IIs型限制性内切酶E和所述IIs型限制性内切酶F均为BsaI;
所述IIs型限制性内切酶B、所述IIs型限制性内切酶C、所述IIs型限制性内切酶G和所述IIs型限制性内切酶H均为Esp3I;
所述启动子1为U6启动子;
所述启动子2为H1启动子;
所述筛选标签1为lacZ;
所述筛选标签2为Amp抗性筛选标签;
所述sgRNA骨架2编码序列为序列2的第1278-1360位。
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