[发明专利]一种荒漠植物霸王的微卫星分子标记及其应用

说明书

本发明提供了霸王(Sarcozygium xanthoxylon Bunge)属植株的微卫星位点SEQ ID NO1～SEQ ID NO9的序列及其引物对SEQ ID NO10～SEQ ID NO27，以及上述微卫星位点与引物对的筛选方法，包括提取DNA、构建DNA‑seq文库并高通量测序；筛选并检测微卫星位点及其特异性引物对等步骤。本发明筛选方法获得霸王的微卫星位点以及特异性引物可以提供在霸王属蒺藜科植株中基因的标记、定位与QTL分析，品种鉴定，种群及进化研究，分子标记辅助育种方面的应用。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种荒漠植物霸王的微卫星分子标记及其应用。

背景技术

霸王(Sarcozygium xanthoxylon Bunge)隶属于蒺藜科，霸王属。是分布于我国西北部干旱荒漠区的小灌木，在蒙古地区也有分布。该植物多生长于干旱的砂地、多石砾地以及覆沙地上，是荒漠灌丛植被的主要优势种和建群种之一。其抗逆性强，生态可塑性大，具有较好的饲用价值和适口性。霸王草地也成为我国西北地区的主要放牧地。然而在我国的分布地区多为生态脆弱地带，尤其因为长期过度放牧退化迅速荒漠化日趋严重，现有霸王群落多分布相对稀疏，且破坏严重，生物量低。

由于自然、历史以及现实的种种原因，目前我国仍然承受着不同程度的荒漠化的严重困扰。根据第三次全国荒漠化监测的数据来看，我国荒漠化面积达到了263.62万Km²，占我国国土面积的27.46％。干旱是世界农牧业面临的最严重问题之一，特别是我国北方地区干旱现象尤为严重。即使在我国湿润和半湿润地区,也常常受到旱灾的侵袭。干旱对世界作物产量的影响,在自然环境胁迫中居首位,其危害相当于其他自然灾害之合。因此,植物抗旱性研究一直是各国科学家关注的重要问题,是当前研究的热点。对植物霸王多态性的研究可为研究植物抗旱机制的研究提供基础材料。

微卫星标记(microsatellite)，又称为短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats，SSR)，是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列，由2～6个核苷酸的串联重复片段构成。由于其有数量多、特异的PCR扩增、稳定性好、在基因组内分布均匀、多态性信息丰富、易于检测等特性等诸多优点成为近年来应用广泛的分子标记之一。然而，关于霸王属植株的基因组微卫星多态性在分子标记开发方面的报道还未见到。

发明内容

有鉴于此，本发明首先提供一种蒺藜科植物霸王的微卫星位点，包括SEQ ID NO 1～SEQ ID NO9的序列的任意一种，即包括以下序列的任意一种：

SxB-1(SEQ ID NO 1)

GGCCTTTTCGGACTTTTTATCGGCTAACCACTCACAGAAAGCGGCAAATTGTTGTTTCTTGTTTTTGTCACTAAAGGGTAGTTGTTTTTCTTGTTCTTGTTTGGTATGAGAGTTTTGGCTATGGGAGTGCAGGAGTTGTTTGGCGGAGTTGTTGTTGTTAGGATCAGGGAATTGACGAGGGAACAAATATGTTGTTTTGTGTGGCATCTTTCTTTCTTTCTTTCTTGATTCTAATCAGACACACAAACACGGTCTTGTTCTTTCTTTTTTGTTTTGTTCGAGCTCGATTAGCCGTCGTCTCTTGTCTTTTGCATGTCCATAGCCAAGCTCGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGTCTAGTGTCTATAAAACCTTGAATGAATGAATGAATGAACGAACAGAGAGGGTTGTTTATTGATTTGATCAAACCAACAAAAGCTAATTACAGTACTAGCTACTTCTCTTGCGATCAACTTTCTTTCACACAATAACACTTTCT

SxB-2(SEQ ID NO 2)