[发明专利]用于现场快速检测多杀性巴氏杆菌的引物、探针及试剂盒在审
申请号: | 201710178429.3 | 申请日: | 2017-03-23 |
公开(公告)号: | CN106811541A | 公开(公告)日: | 2017-06-09 |
发明(设计)人: | 何洪彬;赵贵民;侯佩莉;王洪梅;何成强 | 申请(专利权)人: | 山东师范大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司37221 | 代理人: | 王志坤 |
地址: | 250014 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 现场 快速 检测 多杀性巴氏 杆菌 引物 探针 试剂盒 | ||
1.一种用于现场快速检测多杀性巴氏杆菌的引物和探针组合,包括RPA-nfo正向引物、反向引物和RPA-nfo探针,其特征在于,所述RPA-nfo正向引物、反向引物和RPA-nfo探针的序列如下所示:
正向引物:5'-TTGCCGCGAAATTGAGTTTTATGCCACTTG-3';
反向引物:5'-(Biotin)AATAACGTCCAATCAGTTGCGCCGTTGTCA-3';
探针:5'-(FAM)ATGGCATTATTTTATGGCTCGTTGTGAGTG(dSpacer)GCTTGTCGGTAGTCTT(C3-Spacer)-3'。
2.权利要求1所述的引物和探针组合在制备多杀性巴氏杆菌检测的试剂盒、芯片和/或扩增反应试剂中的用途。
3.一种检测多杀性巴氏杆菌的试剂盒,其特征在于,该试剂盒包含权利要求1所述的引物和探针组合。
4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,试剂盒中还包括有:阳性质控标准品、阴性质控标准品和RPA-nfo反应液。
5.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述阳性质控标准品为包含多杀性巴氏杆菌Kmt1基因片段阳性质控标准品;
优选的,所述的包含多杀性巴氏杆菌Kmt1基因片段阳性质控标准品,由含有192个碱基的核苷酸片段构成的pEASY-T3重组质粒组成;
所述含有192个碱基的核苷酸片段的序列如SEQ ID No.4所示。
6.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述阴性质控标准品为pEASY-T3空载质粒。
7.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述RPA-nfo反应液,包括下述试剂中的至少一种:
recA重组酶、链置换DNA聚合酶、单链DNA结合蛋白、rehydration缓冲液、280mM醋酸镁溶液、侧流层析试纸条、LFD检测缓冲液、灭菌去离子双蒸水,TE缓冲液、SDS、蛋白酶K和多杀性巴氏杆菌标准阳性模板。
8.一种非诊断目的的检测多杀性巴氏杆菌的方法,其特征在于,步骤如下:
(1)检测样本DNA的提取或检测样本的现场裂解处理;
(2)以步骤(1)中处理的样本为模板,利用权利要求1所述的引物和探针组合进行RPA-nfo扩增;
(3)用LFD检测上述RPA-nfo扩增产物,根据检测结果判定样本中是否含有多杀性巴氏杆菌。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述RPA-nfo扩增体系为25μL:其中包括1.0μL的正向引物,1.0μL的反向引物,0.3μL的探针,rehydration缓冲液14.75μL,待测样本DNA或粗裂解产物2μL,ddH2O 4.7μL;将上述23.75μL混合物加入RPA-nfo反应管,充分混匀、溶解,最后加入280mM的醋酸镁溶液1.25μL,上下颠倒混匀后直接在37℃恒温水浴锅处理25min。
10.如权利要求8所述的方法,其特征在于:步骤(3)的具体步骤为:取1μL RPA扩增产物与49μL的LFD检测缓冲液混合,将LFD置入上述混合液中,5min内观察结果,若同时出现检测条带和对照条带,则该样品多杀性巴氏杆菌核酸阳性,仅出现对照条带则说明该样品中不含多杀性巴氏杆菌,如果仅出现检测条带或者无条带则说明RPA-LFD检测不成立。
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