[发明专利]一种用于提取植物RNA的试剂盒以及提取方法有效
| 申请号: | 201710137917.X | 申请日: | 2017-03-09 |
| 公开(公告)号: | CN106801051B | 公开(公告)日: | 2020-09-29 |
| 发明(设计)人: | 段俊;何春梅;张建霞 | 申请(专利权)人: | 中国科学院华南植物园 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星 |
| 地址: | 510650 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 提取 植物 rna 试剂盒 以及 方法 | ||
本发明公开了一种用于提取植物RNA的试剂盒以及提取方法。本发明用于提取植物RNA的试剂盒包括:溶液A:1~2%SDS、10~100mM EDTA(pH 8.0)、0.1~1M Tris‑HCl(pH 7.0~8.0)、0.5~2M NaCl和1~10%β‑巯基乙醇;溶液B:3~7M KAC;溶液C:水饱和酚(pH 4.5);溶液D:体积比为24:1的氯仿和异戊醇;溶液E:异丙醇。本发明用于提取植物RNA的试剂盒可以高效提取得到纯度高且完整性好的植物RNA,是分子生物学的多项实验研究的关键前提,具有良好的应用前景和实用价值。本发明还公开了一种使用上述试剂盒提取RNA的方法。
技术领域
本发明属于分子生物学领域,更具体地说,本发明涉及一种可以从植物中分离到纯度高且完整性好的RNA的试剂盒以及相应的提取方法。
背景技术
在进行植物基因克隆、Northern杂交分析、cDNA文库构建、RT-PCR和Realtime PCR等分子生物学的研究中,需要得到完整的RNA;近年兴起的高通量测序,对RNA的质量和浓度要求更高,高通量测序的RNA浓度要求大于200ng/uL,总量大于15ug。从植物中分离到纯度高且完整性好的RNA,是顺利进行上述的实验关键。
铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)是兰科石斛属多年附生草本植物。由于其水溶性多糖含量较高,从中提取RNA非常困难。这是因为植物组织中水溶性多糖的理化性质与RNA相似,溶于水而不溶于有机溶剂(无水乙醇、异丙醇),很难将它们分开。另外多糖可以还能抑制许多酶的活性,污染了水溶性多糖的RNA样品无法用于进一步的分子生物学研究。另外,由于富含多酚类的植物,在植物组织受到破坏后,就会释放出大量的酚,酚被氧化而形成褐色醌类物质能与RNA稳定结合,很难分离;淀粉也是一类降低RNA质量和产量的物质。所以很难从富含水溶性多糖、多酚和淀粉的植物材料中分离提取到高纯度、高浓度完整的RNA。
目前针对富含水溶性多糖、多酚和淀粉的植物的RNA提取方法和RNA提取试剂盒的效果均不理想,有人通过CTAB法针对富含水溶性多糖多酚的植物进行RNA提取,但存在RNA降解的问题,提取效率低;还有人使用改良版SDS法对植物进行RNA提取,经实验,提取过程中溶液会粘稠成团,无法摇匀,无法进行下一步实验;还有人使用天泽RNA Out2.0进行RNA提取,在水溶性多糖含量低于20%时可以提取到RNA,但效率较低,只能满足一些常规实验,无法满足高通量测序的需求;当水溶性多糖含量更高时,水溶性多糖会与RNA缠绕在一起堵住滤膜,无法洗脱。还有使用低浓度乙醇处理、氯化锂沉淀法等来去除水溶性多糖,但均会使RNA提取效率大大降低。
有鉴于此,确有必要提供一种可以从植物中分离到纯度高且完整性好的RNA的试剂盒以及相应的提取方法。
发明内容
本发明的目的在于:克服现有植物RNA提取中,当植物水溶性多糖、多酚、蛋白质含量较高时出现的影响RNA提取效率等问题,提供一种可以从植物中分离到纯度高且完整性好的RNA的试剂盒以及相应的提取方法。
为了实现上述发明目的,本发明提供了一种用于提取植物RNA的试剂盒,包括:
溶液A:1~2%SDS、10~100mM EDTA(pH 8.0)、0.1~1M Tris-HCl(pH 7.0~8.0)、0.5~2M NaCl和1~10%β-巯基乙醇;
溶液B:3~7M KAC;
溶液C:水饱和酚;
溶液D:体积比为24:1的氯仿和异戊醇;
溶液E:异丙醇。
作为本发明用于提取植物RNA的试剂盒的一种改进,所述试剂盒还包括溶液F,其中,所述溶液F为含有75%乙醇,用于对RNA沉淀进行洗涤。
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