[发明专利]一种乙型肝炎病毒cccDNA的数字微滴PCR检测方法及其试剂盒在审
申请号: | 201710080657.7 | 申请日: | 2017-02-15 |
公开(公告)号: | CN108441578A | 公开(公告)日: | 2018-08-24 |
发明(设计)人: | 张继明;江培学;毛日成 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属华山医院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙) 31268 | 代理人: | 吴桂琴 |
地址: | 200031 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乙型肝炎病毒 试剂盒 微滴 环状脱氧核糖核酸 临床治疗效果 生物技术领域 荧光定量PCR 定量分析 辅助诊断 共价闭合 核酸提取 监测手段 检测结果 检测灵敏 目的基因 灵敏度 种检测 检测 可用 扩增 | ||
1.一种乙型肝炎病毒cccDNA的数字微滴PCR 检测方法,其特征在于,其包括:
在按下述方法设计的引物和探针存在下,用PSAD 酶预处理乙肝病毒DNA,实现对HBVcccDNA 特异性检测:
1) 根据HBV 全序列,在HBV 基因组前C 编码区,设计并合成如下序列的引物和探针:
PCR引物F :5’-TCCCCGTCTGTGCCTTC-3’(nt1547-nt1565)
PCR引物R :5’-CCCCAAAGCCACCCAA-3’(nt1902-nt1887)
2) 组成乙型肝炎病毒cccDNA数字微滴PCR 诊断试剂盒;
3) 制备反应液;
4) PSAD 酶处理HBV DNA;
5) 定量检测待测样品中HBVcccDNA 的含量。
2.按权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述的步骤3)中,反应液每份为26μl,每份反应液中含组分:5×PCR Buffer,0.2mmol/L dNTPs,2.5mmol/LMgCl2,引物HBV-F和HBV-R 各0.2μmol/L, DNA 聚合酶1U。
3.按权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述的步骤4)中,在25μl 总反应体系中:依次加进1μl 25mM ATP,2.5μl10 倍的Buffer,提取的乙肝DNA 模板溶液12.5μl,和0.5μl 的质粒保护DNA 酶,再用25μl,将反应体系置于37℃环境中温育30min,70℃灭活30min。
4.按权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述的步骤5)中,定量检测待测样品中HBVcccDNA 的含量:PSAD 酶处理的HBVcccDNA,浓度分别为108、107、106、105、104copies/ml 的5 个标准品各4μl,各加入步骤(3) 制得的反应液26μl,分别放入各个反应管中进行处理,同时设空白管和阴性对照;各反应管进行扩增,将含待测样品反应管的扩增结果与其它反应管扩增结果比较,得出待测样品中HBVcccDNA 的含量。
5.按权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述的步骤5)中,所述的扩增是于伯乐微滴数字PCR仪中进行扩增:扩增时的温度条件依次为50℃下2 分钟、94℃预变性4 分钟、94℃下15 秒、60℃ 45 秒构成一个循环,共40 个循环。
6.一种乙型肝炎病毒cccDNA数字微滴PCR 检测试剂盒,其特征是:该试剂盒包括成分:如权利要求1所述的一对特异性HBV引物, Taq 酶,Plasmid-Safe ATP-dependent DNase酶,乙型肝炎病毒cccDNA阳性对照,和阴性对照和PCR Buffer。
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