[发明专利]DNA聚合酶链置换活性检测方法及试剂盒在审

专利信息
申请号: 201710071711.1 申请日: 2017-02-09
公开(公告)号: CN108410962A 公开(公告)日: 2018-08-17
发明(设计)人: 盛司潼;孙文龙 申请(专利权)人: 广州康昕瑞基因健康科技有限公司
主分类号: C12Q1/686 分类号: C12Q1/686;C12Q1/48
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 510000 广东省广州市萝*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 单链区 配对区 链置换活性 扩增反应体系 检测 茎环结构 扩增产物 扩增模板 扩增引物 酶切产物 限制性内切酶酶切位点 限制性内切酶 扩增缓冲液 互补配对 检测结果 扩增反应 凝胶电泳 单链环 试剂盒 酶切 制备 测试
【说明书】:

发明公开了一种DNA聚合酶链置换活性检测方法,包括:制备扩增反应体系并进行扩增反应,得扩增产物;所述扩增反应体系包括扩增模板链,扩增引物,待测DNA聚合酶,dNTP以及扩增缓冲液;所述扩增模板链从3’至5’端依次包括第一单链区、茎环结构区和第二单链区;所述茎环结构区从3’至5’方向依次包括第一配对区、单链环区和第二配对区,所述第一配对区和第二配对区完全互补配对;所述第二单链区上含有限制性内切酶酶切位点;所述扩增引物结合在第一单链区上;采用相应的限制性内切酶对扩增产物进行酶切,得到酶切产物;对酶切产物进行凝胶电泳测试,根据检测结果确定DNA聚合酶的链置换活性。本发明的检测方法不会造成环境污染,操作简单,检测成本低。

技术领域

本发明涉及分子生物学领域,更具体地说,涉及一种DNA聚合酶链置换活性检测方法及试剂盒。

背景技术

DNA聚合酶(DNA polymerase)是细胞复制DNA的重要作用酶,主要活性是催化DNA合成。在DNA复制过程中,通常需要在解旋酶协同参与下打开DNA双链螺旋结构,然后再在DNA聚合酶作用下进行DNA合成。部分具有链置换活性的DNA聚合酶具有打开DNA双链氢键的活性,从而使得当体系中不含解旋酶时,也可以同时进行DNA双链打开和合成新的DNA双链。

现有技术文献公开了采用单链环状M13噬菌体DNA检测DNA聚合酶的链置换活性,具体的是利用特异性扩增引物与单链环状M13噬菌体DNA退火,再加入DNA聚合酶进行扩增反应,如图1所示,将特异性扩增引物2锚定在单链环状M13噬菌体DNA 1上,在DNA聚合酶的作用下发生DNA合成反应。当扩增反应进行至与引物5’端时,不具备链置换活性的DNA聚合酶催化的DNA合成反应终止,形成第一扩增产物3;具备链置换活性的DNA聚合酶以链置换的方式继续合成DNA,形成的第二扩增产物4。其中第一扩增产物3和第二扩增产物4均为双链环状结构,第一扩增产物3的双链环状结构中含有特异性扩增引物序列,第二扩增产物的双链环状结构中不含有特异性扩增引物序列。采用同位素元素标记扩增反应体系中的dATP,然后对扩增产物采用碱性电泳测试,通过检测扩增产物的条带大小即可判断DNA聚合酶是否具有链置换活性。但采用同位素标记检测DNA聚合酶链置换活性的方法污染严重,对实验条件要求高、检测成本高。

因此,需要一种无污染、对实验条件要求低、检测成本低的DNA聚合酶链置换活性检测方法。

发明内容

本发明的目的在于提供一种DNA聚合酶链置换活性检测方法及试剂盒,旨在解决现有技术中DNA聚合酶链置换活性检测对反应体系要求高、成本高的问题。

为了实现发明目的,本发明提供了一种DNA聚合酶链置换活性检测方法,包括以下步骤:

A、制备扩增反应体系并进行扩增反应,得扩增产物;所述扩增反应体系包括扩增模板链,扩增引物,待测DNA聚合酶,dNTP以及扩增缓冲液;所述扩增模板链从3’至5’端依次包括第一单链区、茎环结构区和第二单链区;所述茎环结构区从3’至5’方向依次包括第一配对区、单链环区和第二配对区,所述第一配对区和第二配对区完全互补配对;所述第二单链区上含有限制性内切酶酶切位点;所述扩增引物结合在第一单链区上;

B、采用相应的限制性内切酶对扩增产物进行酶切,得到酶切产物;

C、对酶切产物进行凝胶电泳测试,根据检测结果确定DNA聚合酶的链置换活性。

优选的,所述限制性内切酶酶切位点与第二单链区5’末端之间的距离至少为20bp。

优选的,所述第一单链区长度为15至20bp,所述扩增引物与第一单链区完全互补配对。

优选的,所述单链环区的长度为3至10bp。

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