[发明专利]糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位点的分子标记及应用

说明书

本发明提供一种糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位点的分子标记，其特异性检测玉米SNP位点PZE‑104141018和PZE‑104141424。较佳地，包括第一分子标记和第二分子标记，分别特异性检测玉米SNP位点PZE‑104141018和PZE‑104141424。更佳地，第一分子标记是第一CAPS分子标记，其包括SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的第一引物对，第二分子标记是第二CAPS分子标记，其包括SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的第二引物对。还包括相关应用。本发明的糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位点的分子标记可以检测糯玉米淀粉峰值黏度的高低，从而可以对糯玉米的淀粉峰值黏度的高低进行有效选择，还可以用于淀粉高峰值黏度糯玉米的分子标记辅助育种，加速糯玉米优良品质育种的进程，且设计巧妙，检测简便快捷，成本低，适于大规模推广应用。

技术领域

本发明涉及分子生物学及玉米育种技术领域，特别涉及糯玉米淀粉分子标记技术领域，具体是指一种糯玉米淀粉峰值黏度(Peak Viscosity，PV)主效QTL位点的分子标记及应用。

背景技术

糯玉米含有丰富的营养成份，在中国和东南亚国家主要用作鲜食，因而品质是决定糯玉米经济价值高低的重要因素之一。淀粉黏度性状(RVA(rapid visco-analysis)黏度谱值，通过快速黏度分析仪测定)已被证明可广泛应用于评价谷类作物的籽粒品质，包括糯玉米。籽粒淀粉黏度性状中的峰值黏度、终值黏度、崩解值与糯玉米食味品质呈显著或极显著正相关，特别是峰值黏度对鲜食糯玉米的食味品质有重要的决定作用。淀粉黏度性状是经典的数量性状，由涉及许多淀粉相关基因的复杂遗传系统调节，同时还受到非遗传和环境因素的影响。由于这种数量遗传特性，糯玉米育种者很难通过常规方法有效地进行糯玉米籽粒品质的改良。

随着现代生物技术的发展，特别是分子生物学的发展，使剖析作物重要性状的多基因遗传行为成为可能，有利于推动传统的“经验育种”向高效的“精确分子育种”转变。利用玉米基因组学和生物信息学的最新研究成果，构建实用、经济、高效的分子育种技术体系，高效改良目标性状，已经成为现代育种的重要研究方向。

大量与淀粉RVA黏度谱相关的QTL研究已经在多种作物中有所报道，包括水稻(Bao等2000；Bao等2002；Hsu等2014；Xu等2015；Yacouba等2013；Yan等2014；Zhang等2013)，大麦(Wang等2010)和小麦(Liang等2009)。然而，目前尚无与糯玉米淀粉黏度特性遗传机制相关的研究报道。因此，开展糯玉米食味品质显著相关的淀粉峰值黏度的遗传基础研究，鉴定基因组中调控淀粉峰值黏度性状的主效QTL位点，挖掘优异等位变异，开发靶标分子标记，对于选育优质糯玉米品种具有极其重要的意义。

发明内容

为了克服上述现有技术中的缺点，本发明的一个目的在于提供一种糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位点的分子标记，其可以检测糯玉米淀粉峰值黏度的高低，从而可以对糯玉米的淀粉峰值黏度的高低进行有效选择，还可以用于淀粉高峰值黏度糯玉米的分子标记辅助育种，加速糯玉米优良品质育种的进程，适于大规模推广应用。

本发明的另一目的在于提供一种糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位点的分子标记，其设计巧妙，检测简便快捷，成本低，适于大规模推广应用。

本发明的另一目的在于提供一种糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位点的分子标记的应用，其可以用于检测糯玉米淀粉峰值黏度的高低，从而可以用于对糯玉米的淀粉峰值黏度的高低进行有效选择，还可以用于淀粉高峰值黏度糯玉米的分子标记辅助育种，加速糯玉米优良品质育种的进程，适于大规模推广应用。

本发明的另一目的在于提供一种糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位点的分子标记的应用，其设计巧妙，检测简便快捷，成本低，适于大规模推广应用。