[发明专利]水稻紫叶基因PL1的分子标记及其鉴定方法和应用

权利要求书

1.一种水稻紫叶基因PL1分子标记的引物在水稻紫叶基因PL1的定位与克隆中的应用，其特征在于：所述分子标记分别是P1、P2、P3、P4或P5，其对应的引物分别是：

P1：

上游引物：5'—AAATTATTGTTCACACGAAC—3'；

下游引物：5'—CTAAGAGAGGGTGTAATCCG—3'；

P2：

上游引物：5'—AAAACTGCATTCATCCTAAA—3'；

下游引物：5'—TGTTTGTGGAGTGATTATCT—3'；

P3：

上游引物：5'—tcctcatcggcttcttcttc—3'；

下游引物：5'—AGAACCCGTTCTACGTCACG—3；

P4：

上游引物：5'—GGCAATGTCAGTTCCTGATTT—3'；

下游引物：5'—AGGACGAGCACAACATACCC—3'；

P5：

上游引物：5'—AGAGTGATGAGATGATGCTT—3'；

下游引物：5'—TACGCACACTGTTTACACG—3'；

所述水稻为紫叶品种“广紫06”与绿叶品种Sasanishiki杂交，获得F₁，自交后获得F₂分离群体，选择F₂群体中隐性的紫叶单株水稻；

水稻紫叶基因PL1分子标记的具体鉴定方法，包括以下步骤：

以待鉴定水稻材料全基因组DNA为模板，利用分子标记P1、P2、P3、P4和P5对应引物中的一对或多对进行PCR扩增，对扩增产物进行检测：

（1）采用分子标记P1引物进行扩增，若扩增出130bp的扩增片段，则表明有紫叶基因PL1的存在；

（2）采用分子标记P2引物进行扩增，若扩增出197bp的扩增片段，则表明有紫叶基因PL1的存在；

（3）采用分子标记P3引物进行扩增，若扩增出83bp的扩增片段，则表明有紫叶基因PL1的存在；

（4）采用分子标记P4引物进行扩增，若扩增出182bp的扩增片段，则表明有紫叶基因PL1的存在；

（5）采用分子标记P5引物进行扩增，若扩增出107bp的扩增片段，则表明有紫叶基因PL1的存在。

2.如权利要求1所述的水稻紫叶基因PL1分子标记的获取方法，其特征在于包括以下步骤：

将一个紫叶品种“广紫06”与绿叶品种Sasanishiki杂交，获得F₁，自交后获得F₂分离群体，选择F₂群体中隐性的紫叶单株用于紫叶基因PL1的连锁分析和初步定位，获得权利要求1所述的分子标记。

3.一种水稻紫叶基因PL1分子标记的鉴定方法，其特征在于包括以下步骤：

以待鉴定水稻材料全基因组DNA为模板，利用权利要求1所述的分子标记P1、P2、P3、P4和P5对应引物中的一对或多对进行PCR扩增，对扩增产物进行检测：

（1）采用分子标记P1引物进行扩增，若扩增出130bp的扩增片段，则表明有紫叶基因PL1的存在；

（2）采用分子标记P2引物进行扩增，若扩增出197bp的扩增片段，则表明有紫叶基因PL1的存在；

（3）采用分子标记P3引物进行扩增，若扩增出83bp的扩增片段，则表明有紫叶基因PL1的存在；

（4）采用分子标记P4引物进行扩增，若扩增出182bp的扩增片段，则表明有紫叶基因PL1的存在；

（5）采用分子标记P5引物进行扩增，若扩增出107bp的扩增片段，则表明有紫叶基因PL1的存在。