[发明专利]微量细胞水平鉴别单原核胚胎类型的方法和系统

说明书

本发明涉及一种微量细胞水平鉴别单原核胚胎类型的方法和系统，该方法通过对单原核胚滋养层细胞样本进行全基因组扩增，并将扩增得到第一扩增产物与SNP基因芯片杂交获得SNP位点比率及杂合型位点比率，根据SNP位点比率及杂合型位点比率计算获得样本的杂合概率。然后将样本的杂合概率与预设的胚胎分型标准进行比对，根据比对结果对样本的胚胎类型进行预分，获得样本的胚胎类型。上述方法通过对废弃的胚胎进行准确的分型，提高资源的利用率。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种微量细胞水平鉴别单原核胚胎类型的方法和系统。

背景技术

正常的受精卵发育而来的二倍体细胞一般含有两个染色体组，一组来自父亲(父源)，一组来自母亲(母源)。通过显微镜观察辅助生殖过程体外受精后16小时～18小时的合子，正常情况下一般具有两个原核，一个雌原核和一个雄原核，即正常受精胚胎，也称2PN胚胎。但是同时存在着1.6％～7.7％的合子只能看到一个原核，即单原核胚胎，也称1PN胚胎。对于1PN胚胎的处理临床上存在争议，有个例报道认为其可以进行移植有可能出生正常婴儿，也有研究认为1PN的胚胎有较高比例的染色体异常和低的发育潜能。目前的普遍的观点认为1PN胚胎移植风险太大，通常将1PN胚胎认为是异常受精产生的，在临床上视为废弃胚胎，对资源造成浪费。

发明内容

基于此，有必要提供一种在微量细胞水平鉴别单原核胚胎类型的方法和系统。

一种微量细胞水平鉴别单原核胚胎类型的方法，包括以下步骤：

将单原核胚胎样本体外培养至囊胚，取所述囊胚滋养层消化成单细胞，收集微量所述单细胞进行全基因组扩增，得到第一扩增产物；

将所述第一扩增产物与SNP基因芯片杂交，扫描杂交后的所述SNP基因芯片得到SNP位点比率及杂合型位点比率，根据所述SNP位点比率及所述杂合型位点比率计算获得所述样本的杂合概率；以及

将获得的所述样本的杂合概率与预设的胚胎分型标准进行比对，根据比对结果对所述样本的胚胎类型进行预分，获得所述样本的胚胎类型，其中，所述胚胎分型标准包括纯合孤雌胚胎和杂合孤雌胚胎。

一种微量细胞水平鉴别单原核胚胎类型的系统，所述系统包括：

第一扩增装置，用于将单原核胚胎样本体外培养至囊胚，取所述囊胚滋养层消化成单细胞，收集微量所述单细胞进行全基因组扩增，得到第一扩增产物；

基因杂交装置，用于将所述第一扩增产物与SNP基因芯片杂交，扫描杂交后的所述SNP基因芯片得到SNP位点比率及杂合型位点比率，根据所述SNP位点比率及所述杂合型位点比率计算获得所述样本的杂合概率；以及

分型装置，将获得的所述样本的杂合概率与预设的胚胎分型标准进行比对，根据比对结果对所述样本的胚胎类型进行预分，获得所述样本的胚胎类型，其中，所述胚胎分型标准包括纯合孤雌胚胎和杂合孤雌胚胎。

上述微量细胞水平鉴别单原核胚胎类型的方法，通过对单原核胚胎滋养层细胞样本进行全基因组扩增，并将扩增得到第一扩增产物与SNP基因芯片杂交获得SNP位点比率及杂合型位点比率，根据SNP位点比率及杂合型位点比率计算获得样本的杂合概率。然后将样本的杂合概率与预设的胚胎分型标准进行比对，根据比对结果对样本的胚胎类型进行预分，获得样本的胚胎类型。通过上述方法一般仅需3个～5个的微量细胞即可实现对单原核胚胎胚胎干细胞样本分型，将临床上鉴定为单原核胚胎而视为废弃的胚胎更加准确分为纯合孤雌胚胎或杂合孤雌胚胎。其中，纯合孤雌胚胎和杂合孤雌胚胎均可用于建立胚胎干细胞系，两者是研究印记基因和父母源基因组在发育过程中的作用的良好细胞模型，且在细胞替代治疗中孤雌细胞系更容易获得HLA单倍型的细胞系，在配型上有优势，另外可用于药物筛选。纯合孤雌胚胎干细胞两套染色体完全相同，类似于单倍体，配型上比杂合孤雌胚胎干细胞更有优势。上述微量细胞水平鉴别单原核胚胎类型的方法和系统，通过对废弃的胚胎进行准确的分型，提高资源的利用率。