[发明专利]前列腺癌预后方法

权利要求书

1.一种方法，包括以下步骤：

a)基于包括至少两种磷酸二酯酶4D(PDE4D)变体的表达水平的基因表达谱来确定前列腺癌是否存在和/或确定前列腺癌发展状态，所述至少两种磷酸二酯酶4D变体选自包括PDE4D1、PDE4D2、PDE4D3、PDE4D4、PDE4D5、PDE4D6、PDE4D7、PDE4D8和PDE4D9的组，并且其中，所述PDE4D变体中没有任何一个被用作参考基因。

2.一种方法，包括以下步骤：

a)基于包括至少两种磷酸二酯酶4D(PDE4D)变体的表达水平的基因表达谱来确定TMPRSS2-ERG基因融合是否存在或者确定转录因子ERG的表达水平，所述至少两种磷酸二酯酶4D变体选自包括PDE4D1、PDE4D2、PDE4D3、PDE4D4、PDE4D5、PDE4D6、PDE4D7、PDE4D8和PDE4D9的组，并且其中，所述PDE4D变体中没有任何一个被用作参考基因。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中，所述基因表达谱被转换为至少一个前列腺癌PDE指标(PDE-指标)，所述至少一个前列腺癌PDE指标指示前列腺癌是否存在和/或所述前列腺癌进展状态。

4.根据权利要求1或2所述的方法，其中，所述PDE4D变体选自包括PDE4D1、PDE4D2、PDE4D3、PDE4D4、PDE4D5、PDE4D6、PDE4D8和PDE4D9的组。

5.根据前述权利要求中的任何一项所述的方法，其中，所述基因表达谱是通过将所述PDE4D变体的所述表达水平针对至少一种参考基因的表达进行标准化而获得的标准化基因表达谱，所述方法任选地包括在所述标准化之前确定样本中的至少一种参考基因的表达水平的步骤。

6.根据前述权利要求中的任何一项所述的方法，

其为用于对前列腺癌或者前列腺癌的进展状态进行诊断、监测或预后的方法；或者

其为用于为个体识别前列腺癌治疗的适合性的方法，所述方法还包括在个体的所述PDE-指标指示存在前列腺癌或者其中所述个体的所述PDE-指标指示非进展性或进展性前列腺癌进展状态的情况下将所述个体识别为适合于接受前列腺癌治疗；

其为用于对个体进行处置的方法，还包括i)在个体的所述PDE-指标指示存在前列腺癌或者其中所述个体的所述PDE指标指示非进展性或进展性前列腺癌进展状态的情况下将所述个体识别为适合于接受前列腺癌治疗并且ii)对适合于接受前列腺癌治疗的所述个体进行处置。

7.根据前述权利要求中的任何一项所述的方法，其包括在步骤a)之前确定样本中的至少两种磷酸二酯酶4D(PDE4D)变体的表达水平以获得基因表达谱的步骤，所述两种磷酸二酯酶4D变体选自包括PDE4D1、PDE4D2、PDE4D3、PDE4D4、PDE4D5、PDE4D6、PDE4D7、PDE4D8和PDE4D9的组。

8.根据权利要求3和5-7中的任何一项所述的方法，其中，所述至少一个PDE-指标选自以下：

i)PDE-指标_1：

PDE4D7_exp–PDE4D5_exp

ii)PDE-指标_2：

MEAN(PDE4D7_exp&PDE4D5_exp)

iii)PDE-指标_3：

(MEAN(PDE4D5_exp&PDE4D7_exp&PDE4D9_exp))/(PDE4D4_exp)

iv)PDE-指标_4：

(MEAN(PDE4D5_exp&PDE4D7_exp&PDE4D9_exp))/(PDE4D1&PDE4D2_exp)

v)PDE-指标_5：

(MEAN(PDE4D5_exp&PDE4D7_exp&PDE4D9_exp))。