[发明专利]用于核酸文库质量控制和定量的方法、系统和其组合物在审
申请号: | 201680014521.X | 申请日: | 2016-01-11 |
公开(公告)号: | CN107636165A | 公开(公告)日: | 2018-01-26 |
发明(设计)人: | S.贝罗西克;高剑波;陈孝明;H.M.温斯 | 申请(专利权)人: | 生命科技公司 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司72001 | 代理人: | 周蓉,周李军 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 核酸 文库 质量 控制 定量 方法 系统 组合 | ||
1.一种用于测定多个双链核酸的长度范围的方法;其包含以下步骤:
使所述多个双链核酸与a)第一染料和b)经可检测标记的单链大小确定梯在所述第一染料被配置成标记双链核酸的条件下接触;
产生包含多个经第一染料标记的双链核酸和所述经可检测标记的单链大小确定梯的混合物;
使所述混合物在移动性依赖分离条件下迁移;
分离所述多个经第一染料标记的双链核酸中的每一个;以及
测定所述多个经第一染料标记的双链核酸中每一个的迁移时间。
2.根据权利要求1所述的方法,其另外包含以下步骤:测定所述经可检测标记的单链大小确定梯的多个片段中每一个的迁移时间。
3.根据前述权利要求中任一权利要求所述的方法,其另外包含将所述多个经第一染料标记的双链核酸中每一个的迁移时间转换成长度。
4.根据权利要求3所述的方法,其中所述转换步骤包含以下步骤:比较所述经第一染料标记的双链核酸的迁移时间与所述经可检测标记的单链大小确定梯的至少一个片段的迁移时间。
5.根据权利要求4所述的方法,其中所述比较所述经第一染料标记的双链核酸的迁移时间与所述经可检测标记的单链大小确定梯的至少一个片段的迁移时间的步骤另外包含比较所述经第一染料标记的双链核酸迁移时间与所述经可检测标记的单链大小确定梯的多个片段迁移时间。
6.根据权利要求4和5中任一权利要求所述的方法,其中所述转换步骤另外包含基于分配给所述经可检测标记的单链大小确定梯的每个片段的相关性因数分配每个经第一染料标记的双链核酸的长度。
7.根据前述权利要求中任一权利要求所述的方法,其中所述多个双链核酸是具有至少一部分双链结构的核糖核酸。
8.根据前述权利要求中任一权利要求所述的方法,其中所述第一染料被配置成标记所述多个双链核酸的至少一个可检测部分。
9.根据权利要求8所述的方法,其中所述第一染料被配置成标记所述多个双链核酸的相当大一部分。
10.根据前述权利要求中任一权利要求所述的方法,其中所述第一染料被配置成基本上不标记单链核酸。
11.根据前述权利要求中任一权利要求所述的方法,其中所述第一染料非共价标记所述多个双链核酸。
12.根据前述权利要求中任一权利要求所述的方法,其中所述移动性依赖分离是在至少一种变性添加剂存在下进行。
13.根据前述权利要求中任一权利要求所述的方法,其中所述移动性依赖分离条件被配置成维持标记所述多个双链核酸中每一个的所述第一染料标记至少一个可检测的量。
14.根据权利要求13所述的方法,其中所述移动性依赖分离条件包含被配置成维持经第一染料标记的双链核酸至少可检测的量的运行温度。
15.根据权利要求14所述的方法,其中所述运行温度是所述多个经第一染料标记的双链核酸保留所述第一染料标记的温度。
16.根据权利要求12至15中任一权利要求所述的方法,其中所述移动性依赖分离条件基本上维持所述多个经第一染料标记的双链核酸的标记至少第一部分的所述第一染料标记。
17.根据权利要求12至16中任一权利要求所述的方法,其中维持在所述移动性依赖分离条件下的所述经第一染料标记的双链核酸中每一个的比例与所述迁移时间相关。
18.根据权利要求1至11中任一权利要求所述的方法,其中所述移动性依赖分离条件不包含变性添加剂。
19.根据权利要求18所述的方法,其中所述移动性依赖分离条件被配置成基本上维持标记所述多个双链核酸中每一个的所述第一染料标记。
20.根据前述权利要求中任一权利要求所述的方法,其中所述第一染料非共价标记所述多个双链核酸中的每一个。
21.根据权利要求20所述的方法,其中所述第一染料作为嵌入染料标记所述多个双链核酸中的每一个。
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