[发明专利]生物通路的相关性评估和可视化

权利要求书

1.一种评估至少一条通路与感兴趣的疾病的相关性的计算机实现的方法，所述至少一条通路具有源基因和目标可药化的分子实体，所述方法包括：

由处理器开发所述源基因对所述至少一条通路的影响；

由所述处理器开发至少部分地基于所述至少一条通路的更改而利用感兴趣的药物将所述至少一条通路作为目标的值；

由所述处理器识别在所述至少一条通路内所述源基因和所述目标可药化的分子实体之间的关系；以及

组合以下三项：

所述源基因对所述至少一条通路的所述影响；

至少部分地基于所述至少一条通路的更改而利用感兴趣的药物将所述至少一条通路作为目标的所述值；以及

在所述至少一条通路内所述源基因和所述目标可药化的分子实体之间的所述关系；

其中所述组合导致对所述至少一条通路与所述感兴趣的疾病的相关性的评估。

2.如权利要求1所述的计算机实现的方法，其中所述源基因对所述至少一条通路的所述影响包括所述源基因的加权值。

3.如权利要求1所述的计算机实现的方法，其中，至少部分地基于所述至少一条通路的所述更改而将所述至少一条通路作为目标的所述值包括所述目标可药化的分子实体的加权值。

4.如权利要求1所述的计算机实现的方法，其中在所述至少一条通路内所述源基因和所述目标可药化的分子实体之间的所述关系包括所述至少一条通路从所述源基因到所述目标可药化的分子实体的拓扑。

5.如权利要求1所述的计算机实现的方法，还包括由所述处理器将所述评估与所述评估的其它评估相比较地进行排序。

6.如权利要求1所述的计算机实现的方法，还包括，由所述处理器至少部分地基于所述评估来实现所述至少一条通路的简化的可视化。

7.如权利要求6所述的计算机实现的方法，其中所述简化的可视化包括：

创建所述至少一条通路的图，其中所述图包括通过边连接的多个节点；

识别所述图的相关路径；

从所述相关路径移除无信息或不重要的节点，以创建第一子图；以及

简化所述第一子图的关系和相关属性，以创建简化的第二子图。

8.如权利要求7所述的计算机实现的方法，其中所述相关属性包括所述简化的第二子图的所述多个节点或多条 所述边的性质。

9.一种用于评估至少一条通路与感兴趣的疾病的相关性的计算机系统，所述至少一条通路具有源基因和目标可药化的分子实体，所述系统包括：

处理器，所述处理器被配置为开发所述源基因对所述至少一条通路的影响；

所述处理器还被配置为开发至少部分地基于所述至少一条通路的更改而利用感兴趣的药物将所述至少一条通路作为目标的值；

所述处理器还被配置为识别在所述至少一条通路内所述源基因和所述目标可药化的分子实体之间的关系；以及

所述处理器还被配置为组合以下三项：

所述源基因对所述至少一条通路的所述影响；

至少部分地基于所述至少一条通路的所述更改而利用所述感兴趣的药物将所述至少一条通路作为目标的所述值；以及

在所述至少一条通路内所述源基因和所述目标可药化的分子实体之间的所述关系；

其中所述处理器进行所述组合导致对所述至少一条通路与所述感兴趣的疾病的相关性的评估。

10.如权利要求9所述的计算机系统，其中所述源基因对所述至少一条通路的所述影响包括所述源基因的加权值。

11.如权利要求9所述的计算机系统，其中，至少部分地基于所述至少一条通路的所述更改而将所述至少一条通路作为目标的所述值包括所述目标可药化的分子实体的加权值。