[发明专利]一种用于鉴定长江江豚个体间亲缘关系的引物、试剂盒及鉴别方法有效
申请号: | 201611247089.7 | 申请日: | 2016-12-29 |
公开(公告)号: | CN106591462B | 公开(公告)日: | 2020-04-21 |
发明(设计)人: | 唐永凯;徐跑;俞菊华;李建林;刘凯;李红霞;于凡 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 黄欣 |
地址: | 214081 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 鉴定 长江 江豚 个体 亲缘 关系 引物 试剂盒 鉴别方法 | ||
1.一种用于鉴定长江江豚个体间亲缘关系的引物组合,其特征在于:包括有用于扩增的20对微卫星引物,其序列如下:JTSSR1 SEQ ID NO.1~2、JTSSR2 SEQ ID NO.3~4、JTSSR3 SEQ ID NO.5~6、JTSSR4 SEQ ID NO.7~8、JTSSR5 SEQ ID NO.9~10、JTSSR6 SEQID NO.11~12、JTSSR7 SEQ ID NO.13~14、JTSSR8 SEQ ID NO.15~16、JTSSR9 SEQ IDNO.17~18、JTSSR10 SEQ ID NO.19~20、JTSSR11 SEQ ID NO.21~22、JTSSR12 SEQ IDNO.23~24、JTSSR13 SEQ ID NO.25~26、JTSSR14 SEQ ID NO.27~28、JTSSR15 SEQ IDNO.29~30、JTSSR16 SEQ ID NO.31~32、JTSSR17 SEQ ID NO.33~34、JTSSR18 SEQ IDNO.35~36、JTSSR19 SEQ ID NO.37~38和JTSSR20 SEQ ID NO.39~40。
2.根据权利要求1所述的用于鉴定长江江豚个体间亲缘关系的引物组合,其特征在于:所述的每对引物对中至少有一个引物的5’端进行荧光染料标记。
3.根据权利要求2所述的用于鉴定长江江豚个体间亲缘关系的引物组合,其特征在于:每对引物进行标记时是采用FAM和HEX中的任意一种进行染色。
4.包含有权利要求1至3任一项所述的用于鉴定长江江豚个体间亲缘关系的引物组合的试剂盒。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:由如下组成:DNA模板,10×反应缓冲液,Mg2+,dNTP,上下游引物,Taq酶,灭菌双蒸馏水。
6.权利要求4所述的试剂盒鉴定长江江豚个体间亲缘关系的方法,其特征在于:包括以下步骤:
步骤1,采集待鉴别的长江江豚血液,采用碱裂解法提取基因组DNA;
步骤2,以步骤1得到的基因组DNA为模板,进行PCR扩增;
步骤3,将步骤2得到的PCR扩增产物用ABI3730测序仪全自动核酸蛋白分析仪进行毛细管电泳检测;
步骤4,将步骤3得到的测序峰值图的片段大小转化为微卫星标记,得到每个个体的基因型;
步骤5,用遗传分析软件进行分析,对长江江豚个体间进行半同胞、全同胞以及父母本间的亲缘关系鉴定。
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