[发明专利]药物筛选中基于深度哈希的配体分子指纹生成方法

权利要求书

1.一种药物筛选中基于深度哈希的配体分子指纹生成设计方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：

步骤1：生成分子结构式图像文件；

步骤2：定义配体分子对的配对标记，即如果两配体分子与共同的药物靶标作用，则两分子之间的配对标记为1；若两分子分别与不同的药物靶标作用，则两分子之间的配对标记为0，

步骤3：训练DPSH深度哈希学习模型，包括：将配体分子对的两个配体分子的图像文件和配对标记作为DPSH深度哈希模型的输入，提取配体分子对的两个配体分子的图像文件和配对标记作为DPSH深度哈希学习模型，包括：将配体分子对的两个配体分子的图像文件和配对标记作为DPSH深度哈希模型的输入，提取配体分子结构深层次的特征，进行配体分子指纹自动编码，更新网络参数，训练DPSH深度哈希学习模型，使得配对标记为1的两个配体分子，通过模型生成的分子指纹尽可能相似；配对标记为0的两分子，其分子指纹之间差距较大；

步骤4：预测新配体分子的分子指纹。

2.根据权利要求1所述的一种药物筛选中基于深度哈希的配体分子指纹生成设计方法，其特征在于，步骤1通过现有分子软件读取配体分子SMILES，并调用软件中的构图函数，生成固定尺寸为300*300像素的配体分子结构式图像文件，用于表示配体分子的结构特征。

3.根据权利要求1所述的一种药物筛选中基于深度哈希的配体分子指纹生成设计方法，其特征在于，步骤3将步骤1得到的配体分子结构式图像进行预处理，转换成像素大小为224*224的图像形式，并结合步骤2生成的配对标记，一同输入DPSH深度哈希学习模型，提取配体分子结构深层次的特征，进行配体分子指纹自动编码，更新网络参数。

4.根据权利要求1所述的一种药物筛选中基于深度哈希的配体分子指纹生成设计方法，其特征在于，步骤4中当要预测新的配体分子的哈希指纹时，只需将配体分子的结构式图像输入DPSH深度哈希学习模型处理，就能在输出端得到指定长度的指纹向量。