[发明专利]预测肿瘤对TRAIL类似物敏感性的方法有效
申请号: | 201611147049.5 | 申请日: | 2016-12-13 |
公开(公告)号: | CN106591449B | 公开(公告)日: | 2020-09-22 |
发明(设计)人: | 赖兵;姬建新;翟祎星;钟应佳;黄迎春;杨莉;邢晔;陈娇 | 申请(专利权)人: | 成都地奥九泓制药厂 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 成都弘毅天承知识产权代理有限公司 51230 | 代理人: | 杨保刚;晏辉 |
地址: | 610041 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 预测 肿瘤 trail 类似物 敏感性 方法 | ||
1.检测基因表达水平的试剂在制备预测肿瘤对DATR敏感性的产品中的用途,其特征在于:基因包括DR4、DR5、DcR2、CASP8、c-FLIP和HTATIP2,肿瘤细胞株来源于肺,结直肠,胸或肝,检测步骤如下:
(1)以上述的肿瘤细胞株作为样本库,通过实时荧光定量PCR测定样本库中肿瘤细胞株的DR4、DR5、DcR2、CASP8、c-FLIP和HTATIP2六种基因的mRNA表达水平,以Cq值表示;
(2)在体外实验中测定样本库中肿瘤细胞株在浓度为0.0002-12μg/mL的DATR处理下的生存率,生存率=实验组细胞活力/对照组细胞活力,指示其对DATR的敏感性;
(3)以肿瘤细胞株中六种基因的Cq值为自变量,以DATR处理下各肿瘤细胞株的生存率为因变量,通过多元线性回归建模,筛选并建立最优的多元线性方程,公式为:
V=a*Cq(DR4)+b*Cq(DR5)+c*Cq(DcR2)+d*Cq(CASP8)+e*Cq(c-FLIP)+f*Cq(HTATIP2)+g,其中,V指生存率;Cq(X)指qPCR中目的基因X的绝对定量荧光阈值循环数,或相对于GAPDH的相对定量荧光阈值循环数;a-f为系数,g为常数,均可为0;
(4)提取患者肿瘤细胞株或循环肿瘤细胞或肿瘤组织,检测上述基因的mRNA表达水平,即Cq值,代入多元线性方程,通过计算预测该病人对DATR的敏感性。
2.根据权利要求1所述的检测基因表达水平的试剂在制备预测肿瘤对DATR敏感性的产品中的用途,其特征在于,步骤(1)的方法为:
(a)提取肿瘤细胞株的总RNA,以此为模版反转录构建cDNA文库;
(b)利用实时荧光定量PCR检测DR4、DR5、DcR2、CASP8、c-FLIP和HTATIP2六种基因的mRNA表达水平,以Cq值表示。
3.根据权利要求2所述的检测基因表达水平的试剂在制备预测肿瘤对DATR敏感性的产品中的用途,其特征在于,步骤(b)中,
DR4基因的上游引物为5’-AATCAGGCAATGGACATAA-3’,下游引物为5’-GCAACAACAGACAATCAG-3’,
DR5基因的上游引物为5’-TCAGGCATCATCATAGGA-3’,下游引物为5’-TCAGGTAAGGAAGGACTT-3’,
DcR2基因的上游引物为5’-TTGCCTTCTTGCCTGCTA-3’,下游引物为5’-GTCTCTGGTCGTGGTACA-3’,
CASP8基因的上游引物为5’-AAGAGAATGTTGGAGGAA-3’,下游引物为5’-TTAGGTAGGTAATCAGCAA-3’,
c-FLIP基因的上游引物为5’-GATACAGATGAGAAGGAGATG-3’,下游引物为5’-CCTGACATTAGGTGGAAC-3’,
HTATIP2基因的上游引物为5’-GTGAATCAAGAAGTGGTG-3’,下游引物为5’-CAACAGAATCCAACATCAT-3’。
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