[发明专利]药物组合预测系统和药物组合预测方法在审
申请号: | 201611052822.X | 申请日: | 2016-11-25 |
公开(公告)号: | CN108073789A | 公开(公告)日: | 2018-05-25 |
发明(设计)人: | 刘韦驿;邱育贤;徐仁徽;谢嘉珊;蔡孟勳;卢子彬;赖亮全;庄曜宇;萧晖议 | 申请(专利权)人: | 财团法人资讯工业策进会 |
主分类号: | G06F19/20 | 分类号: | G06F19/20;G06F19/28 |
代理公司: | 北京律诚同业知识产权代理有限公司 11006 | 代理人: | 徐金国 |
地址: | 中国台湾台北市*** | 国省代码: | 中国台湾;71 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因组 基因 协同 储存装置 协同基因 预测系统 处理器 数据库 储存 协同药物 运算量 预测 筛选 | ||
一种药物组合预测系统,包含储存装置和处理器。储存装置用于储存数据库,数据库用于储存多个原始基因组、第一药品所影响的至少第一基因和第二药品所影响的至少第二基因。处理器用于将第一原始基因组中的至少第一基因的部分和至少第二基因的部分指定为第一协同基因组,计算第一协同基因组中的基因数量,以取得第一协同基因数量,依据第一协同基因数量在第一原始基因组中所占的第一比例,计算第一药物和第二药物的组合所对应的协同值,并依据协同值筛选出至少一种协同药物组合,借此达到大幅减少了药物组合预测所需的运算量的效果。
技术领域
本发明是有关于一种药物组合预测系统和药物组合预测方法,且特别是有关于一种应用药物协同作用的药物组合预测系统和药物组合预测方法。
背景技术
一般而言,将不同的药物进行组合时,可能会产生药物协同作用,协同作用是指当同时给予两种或两种以上的药物时,作用在靶器官或靶细胞上的效应等于或大于各药物效应的总和,所述效应可以是治疗效应或不良反应。此外,协同作用是确定肿瘤或选用治疗方案的基础,可用于增加效应,也可降低方案中某种药物的剂量,以避免因大剂量用药引起的毒性反应。
因此,将不同的药物进行组合时,药物组合疗效的预测变得十分重要,通过药物组合疗效的预测,可得知将组合后的药物是否具有较佳的疗效。然而,药物组合疗效预测的运算过程复杂,当药物总数过多时,这些药物可以组合的方式众多,其运算的时间会更长,往往需要数天甚至数个月,才能完成运算。
因此,如何有效地筛选药物组合方式,以减少进行药物组合预测的运算量,已成为本领域相关人员所需解决的问题。
发明内容
为解决上述的问题,本发明的一个方面提供一种药物组合预测系统,其特征在于,包含储存装置和处理器。储存装置用于储存数据库,数据库用于储存多个原始基因组、第一药品所影响的至少第一基因以及第二药品所影响的至少第二基因。其中,原始基因组包含第一原始基因组,第一原始基因组包含至少第一基因的部分以及至少第二基因的部分。处理器用于将第一原始基因组中的至少第一基因的部分以及至少第二基因的部分指定为第一协同基因组,计算第一协同基因组中的基因数量,以取得第一协同基因数量,依据第一协同基因数量在第一原始基因组中所占的第一比例,计算第一药物和第二药物的组合所对应的协同值,并依据协同值筛选出至少一种协同药物组合。
依据一个实施例,药物组合预测系统还包含:传输装置,用于接收来自DNA微阵列(DNA microarray)装置所测量的基因表达量(gene expression value),处理器分析基因表达量以得知第一药品所影响的至少第一基因以及第二药品所影响的至少第二基因。
依据一个实施例,其中,所述多个原始基因组包含第二原始基因组;其中,当第二原始基因组包含至少第二基因的部分且不包含至少第一基因时,处理器判断第一药物和第二药物的组合所对应的协同值为零。
依据一个实施例,其中,所述多个原始基因组包含第三原始基因组,第三原始基因组包含至少第一基因的部分和至少第二基因的部分,处理器还用于将第三原始基因组中的至少第一基因的部分和至少第二基因的部分指定为第二协同基因组,并依据第二协同基因组取得第二协同基因数量,计算第二协同基因数量在第三原始基因组中所占的第二比例,并依据第二比例和第一比例,计算第一药物和第二药物的组合所对应的协同值。
依据一个实施例,其中处理器累加第二比例和第一比例以取得影响参数,并将影响参数除以所述多个原始基因组的组数,以取得第一药物和第二药物的组合所对应的协同值。
依据一个实施例,其中处理器还用于判断协同值是否为零,若协同值为零,则排除第一药物和第二药物的组合。
依据一个实施例,其中处理器还用于计算第一药物和第三药物的组合所对应的另一个协同值,并计算协同值与另一个协同值的平均值,当协同值高于平均值时,则将第一药物和第二药物的组合指定为至少一种协同药物组合的其中之一。
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