[发明专利]药物组合预测系统和药物组合预测方法在审
申请号: | 201611052822.X | 申请日: | 2016-11-25 |
公开(公告)号: | CN108073789A | 公开(公告)日: | 2018-05-25 |
发明(设计)人: | 刘韦驿;邱育贤;徐仁徽;谢嘉珊;蔡孟勳;卢子彬;赖亮全;庄曜宇;萧晖议 | 申请(专利权)人: | 财团法人资讯工业策进会 |
主分类号: | G06F19/20 | 分类号: | G06F19/20;G06F19/28 |
代理公司: | 北京律诚同业知识产权代理有限公司 11006 | 代理人: | 徐金国 |
地址: | 中国台湾台北市*** | 国省代码: | 中国台湾;71 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因组 基因 协同 储存装置 协同基因 预测系统 处理器 数据库 储存 协同药物 运算量 预测 筛选 | ||
1.一种药物组合预测系统,其特征在于,所述系统包含:
储存装置,所述储存装置用于储存数据库,所述数据库用于储存多个原始基因组、第一药品所影响的至少第一基因和第二药品所影响的至少第二基因;其中,所述多个原始基因组包含第一原始基因组,所述第一原始基因组包含所述至少第一基因的部分和所述至少第二基因的部分;以及
处理器,所述处理器耦接于所述储存装置,用于将所述第一原始基因组中的所述至少第一基因的部分和所述至少第二基因的部分指定为第一协同基因组,计算所述第一协同基因组中的基因数量,以取得第一协同基因数量,依据所述第一协同基因数量在所述第一原始基因组中所占的第一比例,计算所述第一药物和所述第二药物的组合所对应的协同值,并依据所述协同值筛选出至少一种协同药物组合。
2.如权利要求1所述的药物组合预测系统,还包含:
传输装置,所述传输装置用于接收来自DNA微阵列装置所测量的基因表达量,所述处理器分析所述基因表达量以得知所述第一药品所影响的所述至少第一基因和所述第二药品所影响的所述至少第二基因。
3.如权利要求1所述的药物组合预测系统,其中,所述多个原始基因组包含第二原始基因组;其中,当所述第二原始基因组包含所述至少第二基因的部分且不包含所述至少第一基因时,所述处理器判断所述第一药物和所述第二药物的组合所对应的协同值为零。
4.如权利要求1所述的药物组合预测系统,其中所述多个原始基因组包含第三原始基因组,所述第三原始基因组包含所述至少第一基因的部分和所述至少第二基因的部分,所述处理器还用于将所述第三原始基因组中的所述至少第一基因的部分和所述至少第二基因的部分指定为第二协同基因组,并依据所述第二协同基因组取得第二协同基因数量,计算所述第二协同基因数量在所述第三原始基因组中所占的第二比例,并依据所述第二比例和所述第一比例,计算所述第一药物和所述第二药物的组合所对应的协同值。
5.如权利要求4所述的药物组合预测系统,其中所述处理器累加所述第二比例和所述第一比例以取得影响参数,并将所述影响参数除以所述多个原始基因组的组数,以取得所述第一药物和所述第二药物的组合所对应的协同值。
6.如权利要求5所述的药物组合预测系统,其中所述处理器还用于判断所述协同值是否为零,若所述协同值为零,则排除所述第一药物和所述第二药物的组合。
7.如权利要求5所述的药物组合预测系统,其中所述处理器还用于计算所述第一药物和第三药物的组合所对应的另一个协同值,并计算所述协同值与所述另一个协同值的平均值,当所述协同值高于所述平均值时,则将所述第一药物和所述第二药物的组合指定为所述至少一种协同药物组合的其中之一。
8.如权利要求1所述的药物组合预测系统,其中所述处理器还用于依据所述至少一种协同药物组合,预测药物疗效的排名。
9.一种药物组合预测方法,其特征在于,所述方法包含:
储存多个原始基因组、第一药品所影响的至少第一基因和第二药品所影响的至少第二基因;其中,所述多个原始基因组包含第一原始基因组,所述第一原始基因组包含所述至少第一基因的部分和所述至少第二基因的部分;
将所述第一原始基因组中的所述至少第一基因的部分和所述至少第二基因的部分指定为第一协同基因组;
计算所述第一协同基因组中的基因数量,以取得第一协同基因数量,并计算所述第一协同基因数量在所述第一原始基因组中所占的第一比例;
依据所述第一比例计算所述第一药物和所述第二药物的组合所对应的协同值;以及
依据所述协同值筛选出至少一种协同药物组合。
10.如权利要求9所述的药物组合预测方法,还包含:
接收来自DNA微阵列装置所测量的基因表达量;以及
分析所述基因表达量以得知所述第一药品所影响的所述至少第一基因和所述第二药品所影响的所述至少第二基因。
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