[发明专利]一种用于鉴别刀鲚和短颌鲚的分子标记及其应用有效
| 申请号: | 201610649828.9 | 申请日: | 2016-08-08 |
| 公开(公告)号: | CN106282334B | 公开(公告)日: | 2019-04-23 |
| 发明(设计)人: | 许志强;葛家春;徐宇;邓燕飞;杨鸢劼;潘建林 | 申请(专利权)人: | 江苏省淡水水产研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 傅婷婷;瞿网兰 |
| 地址: | 210017 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 鉴别 线粒体COI基因 分子标记 位点 分子生物学鉴定 碱基变异 经验观察 应用 检测 | ||
1.一种用于鉴别刀鲚和短颌鲚的分子标记,其特征在于所述的分子标记为用SEQ IDNO.3和SEQ ID NO.4所示 引物扩增长江刀鲚和短颌鲚基因组DNA获得的线粒体COI基因目的片段,所述片段的236bp处该位点有一个单碱基变异,变异信息为T>C,刀鲚在此位点为T,短颌鲚在此位点为C。
2.权利要求1所述的分子标记在鉴别刀鲚和短颌鲚中的应用。
3.一种鉴别刀鲚和短颌鲚的方法,其特征在于通过检测权利要求1所述的分子标记来鉴别刀鲚和短颌鲚。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于检测权利要求1所述的分子标记,所述236bp位点为T则是刀鲚,所述236bp位点为C则是短颌鲚。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于提取不同待鉴别鱼类个体的基因组DNA,采用以PCR为基础的限制性片段长度多态法PCR-RFLP对不同个体进行基因分型,从而鉴别刀鲚和短颌鲚。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于提取待鉴别鱼个体的基因组DNA,通过PCR扩增包含该变异位点的线粒体COI基因片段,采用BspACI限制性内切酶对所得到的PCR产物进行酶切,用2%的琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行分离,短颌鲚产生大小分别为216bp和105bp的两个条带,而刀鲚的相应扩增片段不能被酶切,显示为321bp 的单一条带;所述的PCR-RFLP中使用的PCR引物对为SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2;使用的限制性内切酶为BspACI限制性内切酶。
7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于提取待鉴别鱼个体的基因组DNA,PCR扩增含有权利要求1所述分子标记的基因片段,通过直接测序获得所述分子标记的序列信息,从而鉴别该个体是刀鲚还是短颌鲚。
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