[发明专利]用于鉴别霍山石斛的SNP标记及其分子检测方法有效
| 申请号： | 201610301473.4 | 申请日： | 2016-05-09 |
| 公开（公告）号： | CN105779628B | 公开（公告）日： | 2019-04-26 |
| 发明（设计）人： | 黄璐琦;金斌;袁媛;张亚中;蒋超;胡冲;赵玉洋;蒲婧哲 | 申请（专利权）人： | 中国中医科学院中药研究所;安徽省食品药品检验研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 关畅;张立娜 |
| 地址： | 100700 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 用于 鉴别 霍山 石斛 snp 标记 及其 分子 检测 方法 | ||
1.石斛基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性或用于检测石斛基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质在鉴定或辅助鉴定霍山石斛中的应用；
所述SNP位点在石斛基因组中对应于序列表中序列3所示核苷酸序列的第113位；所述SNP位点处的核苷酸为T或G。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述用于检测石斛基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质为如下A）或B）：
A）一种用于鉴定或辅助鉴定霍山石斛的试剂盒，含有如下（a）所示的引物对，以及限制性内切酶AluI或其同裂酶；
（a）根据石斛基因组中如下SNP位点的上游序列和下游序列设计的用于扩增含有所述SNP位点的片段的引物对；所述SNP位点在石斛基因组中对应于序列表中序列3所示核苷酸序列的第113位；所述SNP位点处的核苷酸为T或G；
B）一种用于鉴定中药霍山石斛的引物对，为所述（a）所示的引物对。
3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述用于检测石斛基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质为如下A）或B）：
A）一种用于鉴定或辅助鉴定霍山石斛的试剂盒，含有如下（b）所示的引物对，以及限制性内切酶AluI或其同裂酶；
（b）由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对；
B）一种用于鉴定中药霍山石斛的引物对，为所述（b）所示的引物对。
4.产品，为如下A）或B）：
A）一种用于鉴定或辅助鉴定霍山石斛的试剂盒，含有如下（a）所示的引物对，以及限制性内切酶AluI或其同裂酶；
（a）根据石斛基因组中如下SNP位点的上游序列和下游序列设计的用于扩增含有所述SNP位点的片段的引物对；所述SNP位点在石斛基因组中对应于序列表中序列3所示核苷酸序列的第113位；所述SNP位点处的核苷酸为T或G；
B）一种用于鉴定中药霍山石斛的引物对，为所述（a）所示的引物对。
5.产品，为如下A）或B）：
A）一种用于鉴定或辅助鉴定霍山石斛的试剂盒，含有如下（b）所示的引物对，以及限制性内切酶AluI或其同裂酶；
（b）由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对；
B）一种用于鉴定中药霍山石斛的引物对，为所述（b）所示的引物对。
6.一种鉴定或辅助鉴定待测石斛是否为霍山石斛的方法，包括如下步骤：检测待测石斛的基因组中如下SNP位点处的核苷酸为纯合T还是纯合G还是T和G的杂合，以确定所述待测石斛是否为霍山石斛：若所述待测石斛的基因组中如下SNP位点处的核苷酸为纯合T，则所述待测石斛为或候选为霍山石斛；若所述待测石斛的基因组中如下SNP位点处的核苷酸为纯合G或者是T和G的杂合，则所述待测石斛不为或候选不为霍山石斛；
所述SNP位点在石斛基因组中对应于序列表中序列3所示核苷酸序列的第113位；所述SNP位点处的核苷酸为T或G。
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