[发明专利]一种与苦瓜抗白粉病基因紧密连锁的分子标记及其应用

说明书

技术领域

本发明属于植物分子遗传学技术领域，具体涉及一种与苦瓜抗白粉病基因紧密连锁的分子标记及其该分子标记在苦瓜抗白粉病育种中的应用。

背景技术

苦瓜(Momordica charantia L.)为葫芦科苦瓜属一年生攀缘草本植物，具较高的营养价值和食疗功效。近年来，苦瓜种植面积不断增加，已成为“南菜北运”的主要蔬菜品种和特色产业。白粉病是瓜类蔬菜广泛发生的一种世界性病害，从苗期至收获期均可发生。近年来，随着瓜类蔬菜种植面积的增加和规模化发展，白粉病已成为导致减产和果实品质下降，阻碍绿色生产的主要病害之一。如在广西苦瓜种植基地五塘镇，年栽培面积近2万亩，年产量超过4500万公斤，而白粉病的发病率高达90％以上，因白粉病导致的产量损失近1000万公斤，经济收益损失达1500万元，导致严重的经济损失。

白粉病在苦瓜田间生长的各个时期均可发生，在苗期发病可造成苦瓜生长势减弱，发育迟缓；在开花期发病可导致苦瓜减产20-40％；在结瓜期发病，会导致植株叶片枯黄，果实生长缓慢，植株早衰，严重影响果实的品质和产量。农户在防治白粉病的过程中耗费了大量的劳动力和农资，过度使用的农药对产品质量及环境都造成极大的损害，因此，培育出抗病品种是防御白粉病的一条最安全、经济、有效的途径。

由于白粉病菌只能采用活体保存，发病程度容易受环境影响等特点，给抗病性鉴定带来极大不便，传统抗病育种周期长，需要大量及多代配置杂交组合及接种白粉病观察，严重阻碍了瓜类蔬菜抗白粉病品种选育进程。

随着分子生物学技术的飞速发展，分子育种技术大大加快了抗病育种的进程，显著缩短了抗病品种选育的周期。DNA分子标记技术因其具有多态性高、检测方便、快速、准确等特点，在农作物抗病遗传育种中发挥了极其重要的作用。SLAF-seq(specific length amplified fragment sequencing)技术是由高通量测序技术发展而来。通过生物信息学进行实验方案系统设计，构建SLAF-seq文库，筛选特异长度DNA片段，以高通量测序技术获得海量序列，利用软件进行数据分析比对，获得大量特异DNA片段，进而依据其序列发展出特异分子标记。SLAF-seq技术具有通量高、准确性高、成本低、周期短等突出优势，依其测序结果可直接开发大量特异分子标记。该技术可用于单体型图谱、遗传图谱、关联性图谱、多态性图谱的构建，为分子育种、系统进化、种质资源鉴定提供重要技术保障。

本发明利用SLAF-seq技术开发了一批特异性强、稳定性高的黄瓜白粉病抗性特异分子标记，为育种中导入抗性优良基因进行分子标记辅助选择提供重要基础。

发明内容

为解决上述问题，本发明提供了一种新型苦瓜SNP分子标记，可在苗期白粉病未发病前对苦瓜育种材料中的抗白粉病基因进行分子标记辅助选择，有效的克服了常规育种的不足，简化选择方法和提高育种效率，加快了苦瓜抗病育种的进程。

为了实现上述发明目的，本发明采用以下技术方案：

一种与苦瓜抗白粉病基因紧密连锁的分子标记，所述的分子标记的标号为SLAF4542，其具有如Seq ID NO.1所示的序列。

作为优选，所述的分子标记是由引物对Primer Forward inner和Primer Reverse inner、引物对Primer Forward outer和Primer Reverse outer扩增得到的。

作为优选，所述的引物对Primer Forward inner、Primer Reverse inner、Primer Forward outer和Primer Reverse outer分别具有Seq ID NO.2-5所示的序列。