[发明专利]用于猪肉溯源的DNA条形码编制方法及溯源方法在审
申请号: | 201610226723.2 | 申请日: | 2016-04-13 |
公开(公告)号: | CN105671192A | 公开(公告)日: | 2016-06-15 |
发明(设计)人: | 吴华莉;谈永松;涂尾龙;曹建国 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海领洋专利代理事务所(普通合伙) 31292 | 代理人: | 刘秋兰 |
地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 猪肉 溯源 dna 条形码 编制 方法 | ||
1.一种用于猪肉溯源的DNA条形码编制方法,其特征在于,其包括步 骤:
1)提取猪个体组织中的基因组DNA;
2)以基因组DNA为模板进行PCR扩增,分别使用对应的引物对基因 ADAMTS、DAZL、FBXO32、FUT1、MC4R、MyoG、NR4A1分别扩增1 个SNP位点、对基因PSMB扩增2个SNP位点,得到不同的扩增片段;
3)RFLP分析,将扩增片段分别使用对应的限制性内切酶进行酶切反应, 再用琼脂糖凝胶电泳检测,根据电泳结果判定每个片段对应的基因型,并汇 编成与所述猪个体对应的DNA条形码。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤2)中,PCR扩增使 用的引物序列分别为,
ADAMTS:上游引物序列5′-TGGGGAGATTGTTCCAGAAC-3′,下游引 物序列5′-CTGCAGAACGAAGAAGTAGCC-3′;
DAZL:上游引物序列5′-CGACAGGAATGAGTTTAGCAA-3′,下游引 物序列5′-CCAAAATGGAAGGGAAAAGT-3′;
FBXO32:上游引物序列5′-ATCCCTGAGTGGCATTGCCCAA-3′,下游 引物序列5′-TTCAGCTGCTGCTGCCAGTG-3′-3′;
FUT1:上游引物序列5′-CTTCAGCCAGGGCTCCTTTAAG-3′,下游引 物序列5′-CTTCCTGAACGTCTATCAAGACC-3′;
MC4R:上游引物序列5′-ATGAACTCAACCCATCACC-3′,下游引物序 列5′-TTAATATCTGCTAGACAAATCACAG-3′;
MyoG:上游引物序列5′-TCAGGAAGAACTGAAGGCTG-3′,下游引物 序列5′-GTTTCCTGGGGTGTTGC-3′;
NR4A1:上游引物序列5′-TTCCTCTGGGTCACAACG-3′,下游引物序 列5′-CTCACAGAGTCAATGCCG-3′;
PSMB的两个SNP位点对应引物序列分别为
PSMB(1FR):上游引物序列5′-AGTTAAGCTCAGTCGTGCAG-3′,下 游引物序列5′-TGAAGTGGATCTTTTCGCAG-3′;
PSMB(2FR):上游引物序列5′-AGCTGCGAAAAGATCCACTT-3′,下游 引物序列5′-GGTCTTCTAGCACTGCCAGG-3′。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤3)中,酶切反应所 用的限制性内切酶分别为:
ADAMTS:PvuⅡ;
DAZL:MspⅠ;
FBXO32:SnaBⅠ;
FUT1:HhaⅠ;
MC4R:ClaⅠ;
MyoG:MspⅠ;
NR4A1:DdeⅠ;
PSMB(1FR):Eco81Ⅰ;
PSMB(2FR):Eco72Ⅰ。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,步骤2)中,PCR扩增条 件为:94℃预变性4min;94℃变性30s,52~64℃退火30s,72℃延伸30s, 共30~40个循环;最后72℃延伸10min。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,各个基因PCR扩增对应的 退火温度为:
6.一种基于DNA条形码的猪肉溯源的方法,其特征在于,包括步骤:
1)在饲养阶段采用权利要求1所述的方法编制猪群中每个猪个体对应 的DNA条形码,将每个猪个体的DNA条形码和来源信息一一对应录入形 成数据库;
2)提取待溯源的猪肉组织并采用权利要求1所述的方法编制DNA条形 码,再与所述数据库中的DNA条形码比对识别,进而关联得到待溯源的猪 肉的来源信息。
7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述猪为杜洛克、大白和 长白猪。
8.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述来源信息包括猪品种、 耳号记录、生长记录、配种记录、繁殖记录。
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